Taxones flotantes: identificación y relación con entradas faltantes

ESCAPA, IGNACIO; POL, DIEGO

San Isidro, Buenos Aires

Otro; VII Reunión Argentina de Cladística y Bioestratigrafía; 2007

Las entradas faltantes son una característica común a la mayoría las matrices de datos –morfológicas y moleculares- utilizadas en estudios cladísticos. Taxones que presentan una alta proporción de entradas faltantes (taxones incompletos) son generalmente asumidos como problemáticos y, en algunos casos, excluidos de los análisis. La argumentación más frecuente para esto radica en la relación hipotética entre las entradas faltantes y la ambigüedad de resultados (ver Kearney, 2002). Nixon y Wheeler (1992) utilizaron el término “wildcard” para referirse a un taxón incompleto que ocupa distintas posiciones entre los árboles de máxima parsimonia (MPT), resultando en un consenso estricto poco resuelto. Pese a tratarse de una práctica frecuente, no existe justificación alguna para decidir la exclusión de un taxon a priori del análisis filogenético. En cambio -con posterioridad al análisis- si los taxones flotantes son identificados, es posible excluirlos del conjunto de MPT de forma tal de ganar resolución (i.e., mayor numero de nodos), en lo que se conoce como “consenso reducido” (Wilkinson, 1994). En cuanto a la identificación de taxones flotantes existen en la actualidad diversos métodos; los cuales sin embargo pueden presentar un alto costo computacional o propiedades no deseables. En el presente trabajo se revisa y modifica el índice de “Positional Congruence” (PC; Estabrook, 1992) destinado a la cuantificación de estabilidad de taxones en un conjunto de cladogramas. El PC cuantifica la cantidad de tripletes (enraizados) que contienen a un taxón, evaluando cuántos de éstos son congruentes en todos los MPT, obteniendo una medida de la estabilidad de dicho taxón. Aun cuando PC es la única medida desarrollada para evaluar la estabilidad de hojas, posee importantes sesgos que condicionan y limitan su implementación (e.g., taxones con el mismo grado de conflicto pero ubicados en nodos distantes dentro de un mismo árbol presentan valores distintos de PC). Para solucionar estos problemas se implementa aquí una modificación de este índice, “Positional Congruence” Reducido (PCR), que evalúa independiente los tripletes de las ramas descendientes de cada politomía del consenso estricto, reduciendo la cantidad de comparaciones y eliminando de esta manera los sesgos antes mencionados. El PCR provee una medida del conflicto topológico existente entre las ramas descendientes de un mismo nodo politómico del consenso estricto, no siendo comparable los valores de ramas pertenecientes a diferentes nodos del dicho consenso. El PCR puede utilizarse para seleccionar (en forma iterada) los taxones a eliminar del consenso lo cual posibilita la resolución de grandes politomías en una forma relativamente eficiente.