Análisis in silico de la heterogeneidad y origen de células tumorales de neuroblastoma

FEDERICO JULIÁN GARDE; MARÍA JIMENA MOSNA; LUCÍA PAULA PETRIZ OTAÑO; MARCELO GABRIEL STINSON; DANIELA DI BELLA; ABEL CARCAGNO

Buenos Aires

Congreso; 1. XX Congreso Internacional de Cancerología SAC; 2022

SAC

El neuroblastoma es el cáncer pediátrico más común derivado del linaje simpatoadrenal que, con frecuencia, se origina en las glándulas adrenales. El objetivo de este trabajo consistió en analizar datos transcriptómicos provenientes de la secuenciación masiva por single cell RNA-Seq de tumores de neuroblastoma. Se utilizaron los datos provenientes de Dong et. al. 2020 y Kildisiulte et. al. 2021 que comprenden biopsias de 37 pacientes con neuroblastoma.Para el análisis de los datos se utilizó el software RStudio y principalmente el paquete Seurat. Los datos se procesaron, filtraron y visualizaron a partir de la anotación de los autores. Con el fin de enriquecer el análisis se integraron los distintos datos en un único dataset. A partir de éste se analizó la heterogeneidad celular para dilucidar su origen y sus posibles causas. Adicionalmente, se realizó un análisis de enriquecimiento funcional de los clusters obtenidos para identificar las principales diferencias entre cada uno de ellos y detectar su posible rol en la progresión tumoral. Finalmente, para cada cluster se analizó la expresión de Ascl1, gen cuya alta expresión está asociada a una peor prognosis, para evaluar su representación dentro de cada subtipo celular identificado en los tumores.Los resultados indican que a) las células de neuroblastoma tienen su origen a partir del linaje de los simpatoblastos de la médula adrenal; b) la heterogeneidad celular en los tumores no se debe al origen de sus células sino a las fases del ciclo celular, c) Ascl1 se expresa en los clusters de células en proliferación y en conjunto con genes asociados a la neurogénesis.A partir de los resultados obtenidos se concluye que: a) la integración de datos de distintas fuentes es un método confiable para enriquecer este tipo de análisis b) existe heterogeneidad celular con funciones específicas para cada uno de los clusters identificados c) Ascl1 no tiene un efecto en sí sobre la tumorigenicidad, sino que contribuiría al bloqueo de la diferenciación neuronal terminal favoreciendo de esta manera la progresión tumoral.Estos tipos de estudio favorecerán la identificación de blancos terapéuticos y a la evaluación de nuevas estrategias terapéuticas que puedan contemplar los diferentes subtipos celulares presentes en el tumor.