SNPs de genes candidatos asociados a producción de leche en bovinos Holando y cruzas Holando x Jersey

RASCHIA MA; NICOLAZZI EL; MAIZON DO; BERIBE MJ; CARIGNANO HA; NANI JP; AMADIO AF; POLI MA

Bariloche

Congreso; XLIII Congreso Argentino de Genética; 2014

Sociedad Argentina de Genética

Los estudios de asociación sobre regiones/genes candidatos se basan en una hipótesis previa que sugiere un potencial rol de la región/gen en un fenotipo particular. El objetivo de este trabajo fue identificar asociaciones entre SNPs en regiones y de genes candidatos y valores de cría predichos a partir de la estimación de la producción de leche acumulada a 305 días durante la primera lactancia de bovinos Holando (H) y HolandoxJersey (HxJ). Los valores de cría se obtuvieron con el programa WOMBAT, utilizando un modelo lineal mixto considerando como efectos fijos a la raza, año de nacimiento, tambo y estación y año de inicio de lactancia y el valor genético aditivo de los animales como efecto aleatorio. El análisis de asociación se realizó mediante la estrategia FASTA del paquete GenABEL de R, utilizando la matriz de relaciones genómicas y teniendo en cuenta la estructura poblacional (animales emparentados y raza -H y HxJ). Fueron evaluados 821 animales y 10.227 SNPs (15 bloques). Doce SNPs en 4 cromosomas se asociaron a la producción de leche (1.10-5 < valores p corregidos < 1.10-4). Considerando 100kb a ambos lados de cada uno de los SNPs significativos y utilizando el programa Ingenuity Pathway Analysis, seis genes cercanos a estos SNPs fueron agrupados por poseer funciones comunes. Estos resultados permitirán limitar las regiones a analizar en la búsqueda de variantes alélicas responsables de la variabilidad genética de este rasgo y la conexión funcional establecida entre los genes implicados ayudará a interpretar la interacción biológica existente entre ellos.