Búsqueda y selección de SNPs en genes candidatos relacionados con producción y calidad de leche

RASCHIA MA; AMADIO AF; CARIGNANO HA; NANI JP; BERIBE MJ; POLI MA

Salta

Congreso; XLII Congreso Argentino de Genética; 2013

Sociedad Argentina de Genética

Se consideran genes candidatos (GCs) para producción lechera aquellos que potencialmente pueden alterar la producción o composición de la leche. Su selección se basa en conocer los procesos metabólicos y productos génicos implicados en la generación del rasgo. La selección de variantes alélicas de estos genes para ser incluidas en estudios de asociación debe considerar si las mismas pueden modificar la estructura o función de los productos génicos. Los objetivos de este trabajo fueron aplicar una metodología de selección de GCs relacionados con producción y calidad de leche en bovinos e identificar polimorfismos de nucleótido simple (SNPs) en dichos genes. La selección de GCs se realizó a través de búsqueda bibliográfica en bases de datos públicas (Pubmed y QTLdb). Los SNPs de GCs se seleccionaron también mediante búsqueda bibliográfica (Pubmed, dbSNP y Bovine QTL Viewer) y además por secuenciación de regiones de estos genes en una población de animales Holando, Jersey y cruzas HxJ. La búsqueda en publicaciones sobre QTLs, genes y marcadores moleculares permitió la selección de 27 GCs de 11 cromosomas. La identificación de los SNPs reportados para cada GC (42), así como de SNPs de otros 57 genes asociados al fenotipo (77), y la detección de nuevos SNPs por secuenciación (9), permitió seleccionar 128 SNPs, pertenecientes a 84 genes distribuidos en 21 cromosomas. La genotipificación de estos SNPs de GCs en bovinos lecheros con registros fenotípicos brindará la posibilidad de realizar tests de asociación entre el rasgo de interés y variantes genéticas específicas.