Desarrollo de un panel de SNPs de genes candidatos en bovinos para leche

AMADIO, ARIEL

Corrientes

Simposio; XL Congreso Argentino de Genética; 2011

Sociedad Argentina de Genética

Simposio - Uso de herramientas genómicas en la producción animal La determinación del genoma completo de un organismo provee herramientas necesarias para la identificación de variantes entre individuos. La forma más común de polimorfismos en genomas de mamíferos son las variaciones de nucleótido único o SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), las cuales representarían el 90% de las variaciones. Existen numerosos estudios sobre la utilización de SNPs para la identificación de asociaciones con características productivas en animales. Entre éstos, pueden diferenciarse estrategias que utilicen arreglos con miles de SNPs (conocidos como genome-wide), o estrategias dirigidas con un grupo de SNPs reducidos. Una de las formas de realizar estudios de asociación de SNPs más económica es limitar, mediante una cuidadosa preselección, qué SNPs son probados para una característica determinada. La base de la selección puede ser focalizada hacia genes candidatos seleccionados biológicamente, genes sugeridos por experimentos de expresión diferencial o candidatos posicionales obtenidos a partir de estudios de ligamiento previos. El uso de SNPs que podrían tener consecuencias funcionales, como los cSNPs no sinónimos o localizados en secuencias promotoras es recomendado. La elección del tipo de estudio será básicamente debida a motivos económicos, de disponibilidad de equipamiento y de los objetivos perseguidos. Se muestra el desarrollo de un panel de 93 marcadores que incluyen SNPs relacionados por diversos tipos de estudios con características productivas y/o sanitarias de ganado bovino lechero, para su aplicación en un diseño de medios hermanos paternos de un rodeo comercial de bovinos Holstein y cruzas con Jersey de aproximadamente 1500 animales.