INVESTIGADORES
KAUFFMAN Marcelo Andres
congresos y reuniones científicas
Título:
UTILIZACIÓN DE LA SECUENCIACIÓN DEL EXOMA EN EL DIAGNÓSTICO DE LA LEUCODISTROFIAS
Autor/es:
KAUFFMAN MARCELO; GONZALEZ MORON DOLORES; LOPEZ LIDIA
Reunión:
Congreso; 32 Congreso SANI; 2012
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Neurologia Infantil
Resumen:
Mediante la secuenciación completa del EXOMA, fracción codificante de alrededor de 20000 genes que componen el genoma humano, resulta factible la búsqueda (y hallazgo) del defecto genético responsable de trastornos genéticamente heterogéneos como las leucodistrofias. Nuestro objetivo fue explorar la utilidad diagnóstica de esta tecnología en las leucodistrofias. Secuenciación del exoma completo a partir de ADN genómico de una paciente femenina, mediante captura con kit TruSeq y corrida de secuenciación en equipo Illumina Hiseq 2000. Análisis bioinformático de alineamiento genómico, identificación de variantes y escrutinio de la secuencia focalizado en conjunto de 63 genes etiopatogénicos en las leucodistrofias. Validación por Sanger. Paciente de 25 años que presenta desde la infancia dificultad en adquisición de pautas motoras junto a trastornos en el aprendizaje lentamente evolutivos. En últimos 2-3 años agrega ataxia axial y alteraciones oculomotoras. Además, ha presentado retraso en desarrollo puberal por hipogonadismo hipogonadotrófico. IRMs de encéfalo mostraron alteraciones en la sustancia blanca características de hipomielinización global e hipotrofia del cuerpo calloso. El EXOMA presentaba alrededor de 75000 variantes de nucleótido único y 8000 indels con respecto a genoma de referencia (Hg19). Más de un 90% fueron previamente descriptas en bases de datos poblacionales con una frecuencia mayor al 5% o, localizaban en regiones no codificantes o regulatorias, careciendo de potencial patogénico. 29 variantes no-sinónimo localizaban en genes investigados como etiopatogénicos en leucodistrofias, destacándose heterocigosis compuesta para p.Glu1261Lys y p.Arg1005His en el gen POLR3A. La secuenciación completa del exoma resultó una herramienta útil en el diagnóstico etiopatogénico de las leucodistrofias.
