Análisis de sitios de secuecias Marcadas (STS) en el genoma de la vicuña

RIVERO, MARÍA BELÉN; CORIA, MARÍA SUMAMPA; BARRERA, ANTONIO DANIEL; LONGO, ANDREA E.; MICELI, DORA C.; VALDECANTOS, PABLO A.

Tafi del Valle, Tucumán

Jornada; XXVIII Jornadas Científicas de la Asociación de Biología de Tucumán; 2011

Asociación de Biología de Tucumán

Los STS son secuencias que se encuentran representadas en un genoma una sola vez y por lo tanto corresponden a un solo locus de un determinado cromosoma; presentan la ventaja de que pueden ser identificadas rápidamente mediante amplificación por medio de la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). Estas secuencias están almacenadas en la base de datos UniSTS del NCBI, que alberga solo secuencias STS que se encuentran conservadas en diferentes especies, por lo que la identificación de estos marcadores en genomas aún no secuenciados permite comparar regiones similares del genoma de diferentes especies que poseen el mismo STS. Puesto que la secuencia del genoma de la vicuña no se conoce, el objetivo del presente trabajo fue identificar, en la base de datos UniSTS, marcadores STS conservados presentes en el cromosoma X de especies relacionadas y con esta información diseñar cebadores con secuencias consenso que permitan amplificar cada STS en el cromosoma X de la vicuña. Se localizaron 17 marcadores STS conservados en el cromosoma X correspondientes a 15 loci diferentes; las secuencias de cada uno de estos loci fueron comparadas mediante alineamientos globales utilizando el software MEGA; se diseñaron cebadores específicos para 3 STS correspondientes a los loci TMEM47 (UniSTS: 18374), TMSB15A (UniSTS: 85563) y DMD (UniSTS: 99582). Mediante amplificación por PCR, utilizando ADN genómico obtenido a partir de muestras de sangre de vicuñas, se obtuvieron productos de amplificación únicos para cada STS analizado, los cuales fueron secuenciados en ambas cadenas. Se observó, mediante alineamientos múltiples, un elevado porcentaje de similitud entre estas secuencias nucleotídicas y las de sus respectivos STSs homólogos. La construcción de árboles filogenéticos con estas secuencias agrupó a las vicuñas correctamente junto a otras especies del orden Artiodactyla. Debido a la elevada conservación del cromosoma X en los mamíferos, se propone que el ordenamiento de los STS estudiados sería similar al de los cromosomas X de las especies filogenéticamente relacionadas.