Identificación de genes en Streptomyces sp. M7 asociados con la vía degradativa del hexaclorociclohexano. Determinación de dominios y motivos conservados

SINELI, PEDRO; DÁVILA COSTA, JOSÉ; POLTI, MARTA ALEJANDRA; CUOZZO, SERGIO ANTONIO

Rosario

Congreso; XXIII Congreso Latinoamericano de Microbiología. XIV Congreso Argentino de Microbiología.; 2016

Asociación Latinoamericana de Microbiología

Introducción: El hexaclorociclohexano (HCH) forma parte de uno de los plaguicidas organoclorados más importantes, su aplicaciónsumada a la producción del mismo en el pasado generó un problema actual de contaminación ambiental a nivel mundial. Se conocendiferentes microorganismos capaces de degradar el HCH, cuya vía degradativa está completamente caracterizada en el géneroSphingobium, sin embargo poca información de la misma esta reportada en el género Streptomyces. Existen estudios quedemostraron la capacidad de degradación de los distintos isómeros del HCH en Streptomyces sp. M7, por lo que el objetivo delpresente trabajo fue identificar, en dicho microorganismo, genes involucrados en la degradación del HCH mediante la determinación dedominios y motivos conservados.Materiales y métodos: El secuenciamiento total del genoma de Streptomyces sp. M7 se realizó mediante el uso de 600 Cycles V3Reagent Kit (Illumina) en MiSeq (Illumina). Para la anotación del mismo se utilizó la plataforma RAST y la base de datos KEEG paradeterminar la función de la totalidad de las secuencias. Los alineamientos de secuencias proteicas se realizaron utilizando la matriz deidentidad BLOSUM62.Resultados: En el genoma de Streptomyces sp. M7 se identificaron genes que codifican para diferentes enzimas relacionadas con ladegradación del HCH. Las mismas tendrían potencialmente actividad dehidroclorinasa (linA), haloalcano declorinasa (linB) y alcoholdeshidrogenasa (linC). En el caso de linA se identificaron tres genes los cuales poseen el dominio Snoal_4 correspondiente a laenzima LinA de Sphingobium y presentaron un 20% de identidad con esta enzima. Ademas, en dichas secuecnias se identificó el sitiocatalítico D25; H73. Por otra parte, se identificaron dos secuencias con potencial actividad haloalcano declorinasa (linB), las mismaspresentaron el dominio de α/βHydrolasay posibles sitios activos, ya que existe diversidad entre las diferentes secuencias descriptas.Así mismo se identificaron tres secuencias con potencial actividad alcohol deshidrogenasa (linC), cuyos dominios y motivosconservados coincidieron con la enzima descripta en Sphingobium, por ejemplo el sitio activo ?YXXK?, además de los sitios de unión acofactores como ?TGXXXGX(12)G?.Conclusiones: Se identificaron genes cuyas secuencias codifican para enzimas con potenciales actividades dehidroclorinasa,haloalcano declorinasa y alcohol deshidrogenasa, necesarias para la degradación del HCH, en el genoma de Streptomyces sp. M7, loque impulsa a estudiar la expresión heteróloga de los mismos.