Estudios filogenómicos, parsimonia y verosimilitud

AMBROSIO TORRES; SANTIAGO A. CATALANO; GOLOBOFF, PABLO A.

Bogotá

Congreso; V Congreso Colombiano de Zoologı́a; 2018

Sociedad Colombiana de Zoología

Las nuevas técnicas de secuenciación hacen cada vez más común las filogenias basadas en datos genómicos. La cantidad de datos y el uso de múltiples genes (que difícilmente se ajusten a los supuestos de homogeneidad de los métodos de verosimilitud) requiere de una reevaluación del comportamiento de los diferentes métodos filogenéticos. Hasta el momento no hay evaluaciones empíricas de la incongruencia entre resultados obtenidos bajo diferentes métodos en un número considerable de datasets. En este trabajo comparamos los resultados obtenidos mediante parsimonia (MP) y máxima verosimilitud (MV) para 150 datasets filogenómicos. Los resultados mostraron una alta concordancia entre ambos métodos (2.4 movimientos-SPR en promedio): 65% de los árboles de MP y MV fueron idénticos o diferían solo en un movimiento-SPR. En general las diferencias no afectaron las conclusiones de los estudios, y estuvieron asociadas a nodos con bajo apoyo. Sólo el 2% de los nodos incongruentes correspondieron a diferencias en nodos muy apoyados. MP con pesos implícitos en general no produjo mayor congruencia con MV que MP bajo pesos iguales. Los taxones con altos niveles de datos faltantes (DF) y/o mayores largos de ramas (LR) estuvieron involucrados en la mayoría de los nodos incongruentes. Por otro lado, no encontramos asociaciones entre contenido de GC y las diferencias observadas. Las propiedades evaluadas afectan a MP y MV (siendo MP más sensible a diferencias en LR, y MV más sensible a DF). Estas comparaciones sugieren que los resultados de MV y MP para datos filogenómicos son, en la práctica, equivalentes.