Moviloma plasmìdico de una bacteria de suelo: exploración del presente y recuerdos del pasado.

LOPEZ J.L.; LOZANO M.J.; SALAS M.E.; MOGRO, E.; ALBICORO F.J.; NILSON J.; CASTELANI L.; TORRES TEJERIZO G.A.; DRAGHI WO; DEL PAPA M. F.; PISTORIO M.; LAGARES A.

Mar del Plata

Congreso; IV Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental-CAMAYA; 2018

Asociaciòn Argentina de Microbiologìa

Los rizobios son alfa- y beta-proteobacterias concapacidad de formar nódulos fijadores de nitrógeno en asociación con raíces deplantas leguminosas. A pesar de esta característica común a los rizobios, losgenomas de los mismos son altamente diversos atento a que constituyen un grupo muyheterogéneo de bacterias más allá de la genética conservada vinculada a susgenes simbióticos (ej. genes nod). Desde el punto de vista genómico-estructural muchosrizobios (aunque no todos) poseen genomas multipartitos constituidos por uncromosoma, por uno o más megaplásmidos (miles de kilobases) portadores de genessimbióticos, y por plásmidos (de tamaño medio-alto, decenas a centenas dekilobases) conocidos como plásmidos crípticos atendiendo a que las funcionesasociadas a los mismos son mayormente desconocidas. El conjunto de genes contenidoen plasmidos es conocido en términos genéricos como plasmidoma, o como movilomaplasmídico cuando se quiere hacer mención al carácter móvil-conjugativo demuchos representantes de este compartimento genético. Tomando como modelo alrizobio modelo Sinorhizobium meliloti, simbionte de Medicago, Melilotus y Trigonella que hemos estudiado en el laboratoriodurante años, en este trabajo mostraremos un análisis compartivo del contenido informacionalde cada uno de sus compartimentos genéticos (cromosoma, pSymA, pSymB, plasmidomacríptico). Mostraremos la heterogeneidad genética de cada uno de ellos a nivelde especie, y el grado relativo en que cada replicón incorpora nuevainformación por transferencia génica horizontal. Por otra parte mostraremoscómo el uso de herramientas filogenéticas acopladas al análisis del uso decodones por el rizobio pueden ser utilizadas para identificar grupos de genes dedistinta ancestralidad utilizando al cromosoma como modelo de análisis.Mostraremos finalmente que el uso de codones en los grupos de genes másancestrales es el mejor adaptado a la maquinaria traduccional del rizobio, yque dicha observación es un hecho frecuente también presente en otras bacteriasno simbióticas gram-negativas y gram-positivas muy diferentes de los rizobios.Los resultados que hemos obtenido han permitido poner en evidencia laplasticidad relativa de cada uno de los compartimentos genómicos, su relacióncon el moviloma plasmídico, y el modo en que la preferencia en el uso decodones se modifica en tiempos evolutivos con un sesgo hacia aquel que esutilizado por los genes más altamente expresados.