Changing of non coding RNA levels associated to nodulation efficiency

RIVERO, CLAUDIO; CLÚA, JOAQUÍN; ZANETTI, MARÍA EUGENIA; BLANCO, FLAVIO

Workshop; Biología Celular y Molecular del RNA Workshop; 2018

En condiciones limitantes de nitrógeno, las raíces de las plantas leguminosas establecen una relación simbiótica con bacterias del suelo llamadas rizobios. Esta interacción conduce a la formación de un nuevo órgano, el nódulo, donde las bacterias llevan a cabo la fijación de nitrógeno. Durante esta interacción ocurre una reprogramación genética de la célula de la raíz que inicia la organogénesis del nódulo y el programa de internalización de la bacteria. En nuestro laboratorio se realizaron estudios de transcriptómica para abordar la pregunta de cuáles son los genes involucrados en la respuesta de Phaseolus Vulgaris a las distintas moléculas señales del rizobio, mediante ensayos de inoculación con cepas de rizobios con diferente eficiencia en la simbiosis, como así también con mutantes defectivos en la síntesis de moléculas señales involucradas en la interacción. En este contexto, enfocamos nuestro análisis en la subpoblación de RNA no codificantes largos (lncRNAs), los cuales han emergido como reguladores finos de la expresión génica. A partir del análisis pudimos identificar lncRNAs candidatos que podrían tener un rol importante en la nodulación eficiente. Hemos avanzado en la caracterizarización de algunos de estos genes mediante genética reversa, El uso de RNAi nos ha permitido estudiar el rol de estor lncRNAs en respuesta a cepas de rizobio con diferente eficiencia simbiótica.