ANÁLISIS DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA DE LOS GENES QUE CODIFICAN LAS PROTEÍNAS ESTRUCTURALES DE ROTAVIRUS GRUPO A

SALVATIERRA KARINA; ANALIA SANCHEZ; AGUILERA JONATHAN; SAMUEL MIÑO

Asuncion

Workshop; DESAFÍO DE LAS INFECCIONES VIRALES CON IMPACTO EN LA SALUD: UN ENFOQUE MULTIDISCIPLINARIO; 2020

Rotavirus grupo A es el principal agente etiológico de enfermedades diarreicas en animales y humanos. El genoma posee 11 segmentos de ARN de doble cadena que codifica seis proteínas estructurales (VP) y cinco o seis no estructurales. Se clasifican en base a su genoma en Gx-P[x]-Ix-Rx-Cx-Mx-Ax-Nx-Tx-Ex-Hx, para los genes de VP7, VP4, VP6, VP1, VP2, VP3, NSP1, NSP2, NSP3, NSP4 y NSP5 respectivamente. Debido a la diversidad genética observada, 36-G, 51-P, 26-I, 22-R, 20-C y 22-M, en 2018 se sugirió revisar el sistema de clasificación actual. El objetivo de este trabajo fue estudiar la variabilidad genética de los segmentos que codifican las 6 proteínas estructurales. Se utilizaron secuencias disponibles en el GenBank, alineadas con MAFFT, editadas con AliView, los análisis de calidad con TempEst e IQ-Tree y, los árboles de máxima verosimilitud se obtuvieron con IQ-tree. Las distancias genéticas intra y entre grupos fueron calculadas con MEGA. Los árboles filogenéticos poseen topología de estrella en todos los genes. En 5 genes se observan grupos dominantes, monofiléticos y con elevado valor de soporte. Los análisis de distancia génica muestran que varios genotipos se podrían agrupar. Los valores de corte basados en la similitud genética definen el sistema de clasificación. Sin embargo, en la última década la cantidad de genotipos aumentó considerablemente. En este trabajo, combinando los análisis filogenéticos con los análisis de distancias dentro y entre grupos observamos que algunos genotipos podrían agruparse, reduciendo así el número de genotipos totales. Sin embargo, esta propuesta necesita ser evaluada por el comité internacional.