Filodinámica aplicada a una epidemia del virus de la Fiebre Aftosa en la Argentina.

MARCELO M. GÖTTE, ; ANDRÉS M. PEREZ,; GUIDO A. KÖNIG

Buenos Aires

Congreso; XXXVI Reunión Científica Anual Sociedad Argentina de Virología; 2016

Sociedad Argentina de Virología

Filodinámica aplicada a una epidemia del virus de la Fiebre Aftosa en la Argentina. Marcelo M. Götte(1), Andrés M. Perez(2), Guido A. König(1),(3)(1)CONICET, (2)Universidad de Minnesota, (3)Instituto de Biotecnología, INTA.La filodinámica es un área nueva de estudio que describe la relación entre la variabilidad genética de un patógeno, su capacidad de transmisión y su dinámica epidemiológica, en una escala de tiempo determinada. La Fiebre Aftosa (FA) es una enfermedad viral altamente contagiosa que afecta a los principales tipos de ganado (bovino, ovino, caprino, porcino). La última gran epidemia provocada por el virus de la FA que afectó a nuestro país ocurrió durante los años 2000-2001. En trabajos previos determinamos la existencia de más de una cepa del virus circulante siendo la principal de serotipo A y denominada A/Argentina/2001. El objetivo del trabajo es determinar el origen temporal y espacial de la cepa A/Argentina/2001 y su dinámica evolutiva durante la epidemia. Para ello se analizaron 120 secuencias de la región P1 del genoma del virus (2200 bases) muestreadas proporcionalmente a la cantidad de brotes ocurridos en cada mes y región. Luego se determinó con el programa Beast el origen temporal y espacial del ancestro común más reciente (ACMR) de la cepa. En el primer caso, se realizó una análisis de coalescencia mientras que para el análisis espacial se determinó con el programa Bats la existencia de diferenciación estructural en la población viral del país para luego analizar el origen geográfico con un modelo de expansión poblacional viral discreto con el programa Beast. Finalmente se analizó, con el mismo programa utilizando el modelo GMRF Skyride, la dinámica de la población del virus originada por esta cepa a través del tiempo y se lo comparó con los reportes de brotes denunciados durante la epidemia. El país, de esta manera, fue dividido en 8 regiones sobre las cuales se encontró evidencia de diferenciación estructural. Estas regiones fueron: (Buenos Aires Norte (BANor), Buenos Aires Mar y centro (BAmyc), Buenos Aires oeste y La Pampa (Oes); Córdoba (Cor), Santa Fe (SF), San Luis (SL), Tucumán, Entre Ríos, Chaco, Corrientes, Misiones, Santiago del Estero en conjunto (Nor) y Formosa (For). Realizando el análisis filogeográfico, se determinó, con un alto grado de certidumbre, que la mayoría de los subgrupos de A/Argentina/2001 eran originarios de la provincia de Formosa, mientras que el grupo mayoritario tuvo su origen en BANor. Por otro lado, se pudo inferir el origen del ACMR en junio del año 2000 (2000,37 (HPD95% 2000,21-2000,52)), solo 15 meses antes del primer aislamiento de la cepa. Finalmente el grafico que representa la dinámica poblacional viral es congruente con el número de brotes del VFA reportados en la etapa exponencial de la epidemia pero no logra reflejar correctamente la etapa de decrecimiento del nº de casos de la enfermedad.En conclusión, el análisis filodinámico de la cepa A/Argentina/2001, responsable de la mayor parte de los casos de la epidemia, brinda nueva información sobre la misma aportando datos concretos sobre su origen y evolución.