Epidemiología molecular del virus de la Fiebre Aftosa en Argentina: variación genética y su relación con aislamiento temporal y geográfico a nivel local

GUSTAVO SEBASTIÁN CABANNE; ANDRÉS PEREZ; GUIDO KÖNIG

Villa Giardino

Congreso; XXX Reunión Científica Anual de la Sociedad Argentina de Virología; 2010

Sociedad Argentina de Virología

El virus de la Fiebre Aftosa (VFA) posee alta tasa evolutiva. En determinadas circunstancias, factores epidemiológicos (p. ej. aislamiento geográfico y/o temporal) pueden ser útiles para entender la variación genética entre brotes. De acuerdo a un estudio previo realizado en el nivel nacional con la cepa A Arg 2001 y con el gen VP1 (8% del genoma), se espera encontrar entre brotes una divergencia de 0,15% cada 100 Km y de 0,3% por cada mes de desfasaje temporal. En este trabajo estudiamos la variación genómica del VFA en una única localidad (nivel local). Específicamente se pretendió: a) entender la magnitud de la diversidad genética a nivel local y su relación con la diversidad genética regional (nivel país), y b) evaluar en el nivel local la relación entre la variación genética y la divergencia temporal y geográfica entre brotes. Se analizaron muestras de campo de la cepa A Arg 2001. El estudio local se hizo en Mar Chiquita, Buenos Aires (MCh, aprox. 60 x 60 Km). Se diseñaron primers para amplificar y obtener secuencias de los genomas completos de estos aislamientos. Se utilizó dos conjuntos de secuencias: datos I) nivel regional, gen VP1 (0,64 kb), de Argentina y Uruguay, n total = 50, n de MCh = 17; datos II) nivel local, genoma total (8,2 kb), de Argentina y Uruguay, n total = 20, n de MCh = 15. A excepción de cuatro, todos los genomas completos son datos originales. Se realizaron estudios a nivel regional (con datos I) y local (datos II). En el nivel regional se evaluó la relación de MCh con otras regiones. Esto se hizo con VP1 y con el genoma completo, usando redes de haplotipos y árboles filogenéticos. En el estudio local se hizo una correlación múltiple no paramétrica, donde la variable dependiente fue distancia genética no corregida entre brotes (Dgen) y las variables independientes fueron distancia geográfica (Dgeo) y diferencia temporal entre brotes (Dt). La diversidad dentro de MCh representó ~10 % de la diversidad al nivel país (razón de diversidades nucleotídicas no corregidas, gen VP1: 0,42%/4,67% = 0,089). El estudio con el genoma completo, en contraposición con el de VP1, indicó que las muestras de MCh conformaron una única unidad genética. A nivel local Dgen varió de 0,04% a 0,52%, y Dgeo y Dt varió de 6 a 62 Km y de 0 a 53 días, respectivamente. La Dgen entre el primer y último aislamiento de MCh fue 0,21%. La correlación múltiple no indicó relación entre Dgen y Dt (P=0,75) o entre Dgen y Dgeo (P=0,15). Conclusiones. Las muestras de MCh se agruparon en una unidad genética, lo que sugirió una única introducción viral. Las Dgen fueron compatibles con lo esperado de acuerdo a estudios previos con VP1. La ausencia de una relación coherente entre la divergencia genética y la distancia temporal y geográfica entre brotes insinúa que el virus circuló sin restricciones en MCh. Esto sugirió que, para la escala local estudiada, tiempo y distancia geográfica no son indicadores fiables de cambios genéticos entre brotes.