Implementación y ajuste de protocolos de caracterización de modelos de interacción AG/AC utilizando al VFA de serotipo C

RUBEN MARRERO; RAMIRO RODRIGUEZ LIMARDO; ELISA CARRILLO; GUIDO KÖNIG; ADRIÁN TURJANSKI

Villa Giardino

Congreso; XXX Reunión Científica Anual de la Sociedad Argentina de Virología; 2010

Sociedad Argentina de Virología

El presente trabajo trata sobre la implementación y validación de un método bioinformático para caracterizar aspectos estructurales de la interacción antígeno/anticuerpo (Ag/Ac) en el sitio inmunogénico principal (SIP) del Virus de la Fiebre Aftosa (VFA) de serotipo C. Se utilizó el software FoldX para modelar computacionalmente más de 200 mutantes puntuales de un péptido representativo del SIP de VFA y para calcular las variaciones en la Energía de Interacción (ΔEI) de las mutantes con dos anticuerpos monoclonales (MABs). Los datos experimentales cristalográficos para el experimento in silico provienen de la base de datos PDB (Protein Data Bank). Los valores de ΔEI obtenidos fueron ordenados en una matriz posicional de energías de interacción (MEI). Estos resultados fueron comparados con los obtenidos en la matriz experimental de referencia (MER) desarrollada a partir de los valores resultantes de ensayos de ELISA competitivos entre los péptidos mutantes y el péptido original (WT), publicados previamente. La matriz MEI obtenida por el método computacional explica más del 50% de los resultados globales en la matriz MER y más del 80% de los resultados de las posiciones relevantes a la interacción de VFA con MABs. Adicionalmente, calculamos nuevas matrices de energía para caracterizar la interacción pero desde el punto de vista de los anticuerpos; modelando más de 100 mutantes puntuales en la secuencia de los CDR3 de dichos MABs. En este experimento el método FoldX pudo detectar que las 2 posiciones aminoacídicas menos tolerantes a mutaciones en las matrices de ΔEI coinciden con aquellas posiciones referidas en la bibliografía como relevantes en la interacción Ag/Ac. En resumen, nuestros resultados demuestran que los características estructurales principales de la interacción entre 2 anticuerpos monoclonales y el sitio A de aftosa del serotipo C, pueden ser detectadas y descritas usando el programa FoldX. Dicho método computacional, podría transformarse en una herramienta útil en el estudio antigénico de este y otros serotipos de VFA.