Dinámica de la evolución viral de las cepas de serotipo A del Virus de la Fiebre Aftosa durante la epidemia 2000-2002

MARCELO GÖTTE; ANDRÉS PEREZ; CLAUDIA PEREZ; GUIDO KÖNIG

Buenos Aires

Congreso; II Congreso Latinoamericano de Virología; 2015

Asociación Argentina de Microbiología

IntroducciónLa Fiebre Aftosa es una enfermedad viral altamente contagiosa. Durante los años 2000-2002 se produjo en Argentina la epidemia más grande de las últimas décadas, en la misma estuvieron involucradas dos cepas virales del serotipo A, identificadas como A2000 y A2001, distantes filogenéticamente. ObjetivoSe estudió la dinámica de las cepas A2000 y A2001 con el objetivo de determinar posibles focos de introducción de la enfermedad y las relaciones filogenéticas y filogeográficas de los brotes secuenciados y la dinámica de la epidemia a nivel nacional.MetodologíaDurante la epidemia 2000-2002 en Argentina, se produjeron múltiples brotes en todo el país, los cuales se muestrearon a nivel nacional, de manera proporcional a la cantidad de brotes ocurridos en cada mes y región, durante la fase de crecimiento exponencial de los brotes del virus. El genoma viral se amplificó por RT-PCR y luego se secuenció por el método de Sanger, obteniéndose en promedio, 4 lecturas de cada una de las posiciones en estudio. El ensamblado de los contigs se realizó, con el programa ?Codon Code Aligner?. Las secuencias consenso se alinearon con el programa ?BioEdit?. Se realizaron filogenias con los parámetros en default para hacer un reconocimiento inicial de la filogenia, luego se determinó el modelo molecular que mejor ajusta a los datos por medio del JMODEL test utilizando el AIC. Las filogenias se realizaron con ?MEGA 5.05? por distintos métodos, distancias(Neighbor Joining), máxima parsimonia, y máxima verosimilitud. El fragmento de genoma analizado es de aproximadamente 2,2Kb, corresponde a la región completa que codifica para las proteínas estructurales (P1). Resultados y DiscusiónSe logró una buena cobertura muestral a lo largo de la fase de crecimiento exponencial de los brotes de la epidemia. Incluso, en los meses en los cuales se produjo el reemplazo de la cepa A2000 por la A2001 se generaron más secuencias con el objetivo de determinar la dinámica evolutiva de ambas cepas. En total se generaron 98 nuevas secuencias y se sumaron al análisis 25 secuencias obtenidas en otro estudio de nuestro laboratorio. .En la filogenia obtenida se observa una completa separación de ambas cepas en clados totalmente independientes que probablemente correspondan a distintos focos de introducción de la enfermedad. A su vez, la cepa A2001 se puede categorizar en 3 subgrupos que muestran una tendencia a la asociación temporoespacial, aunque no exclusiva ya que se observa superposición de los grupos en ambas variables. En conclusión, la separación genética entre ambas cepas, se ve reafirmada en este trabajo, mientras que dentro del clado de la cepa A2001 se marca una tendencia a la diferenciación en subgrupos que en parte se superponen durante el proceso de reemplazo de los mismos en la fase de crecimiento exponencial de la epidemia.