Citometría de flujo y secuenciación masiva: una combinación promisoria para el estudio de la diversidad de microorganismos acuáticos no cultivables

UNREIN, F.

Congreso; IV Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental (CAMAYA); 2018

Los microorganismos juegan un papel determinante en los ciclos biogeoquímicos de los sistemas acuáticos. En particular el picoplancton, aquellos menores a 2 µm, son los organismos más abundantes de los ecosistemas y un componente fundamental dentro de las tramas tróficas de los lagos y océanos. Durante las últimas décadas, el desarrollo de técnicas basadas en tinciones fluorescentes, como la microscopía de epifluorescencia y la citometría de flujo, permitieron demostrar entre otras cosas que la abundancia de bacterias era varios órdenes de magnitud más elevada de lo que se podía estimar en crecimiento por placa. Esto generó, un cambio de paradigma en el conocimiento acerca de la estructura de las tramas tróficas acuáticas. La incorporación de técnicas de biología molecular a la ecología acuática asimismo revolucionó el conocimiento que se tenía de la diversidad de microorganismos. Los primeros trabajos de clonado de muestras ambientales de los genes ADNr 16S y 18S, para procariotas y eucariotas respectivamente, revelaron la existencia de una enorme diversidad de microorganismos, muchos de los cuales eran completamente desconocidos para la ciencia hasta ese momento. La aparición durante la última década de técnicas de secuenciación masiva está generando un avance exponencial en los estudios de diversidad y filogenia de microorganismos acuáticos. Actualmente, la combinación de estas técnicas con la capacidad de sorting de la citometría de flujo representa una herramienta sumamente poderosa y promisoria que permite vincular de manera directa la diversidad morfológica con la diversidad molecular.