La diversidad citométrica como herramienta para identificar patrones ecológicos

UNREIN, F.

Rocha

Taller; 1er Taller de la Red colaborativa en Ecología Microbiana Acuática en América Latina (μSudAqua); 2017

La citometría de flujo es una técnica ampliamente utilizada para cuantificar microorganismos acuáticos, en particular bacterioplancton y microalgas. La ventaja que tiene esta técnica es la gran cantidad de células que pueden ser analizadas en muy corto tiempo. Básicamente, cada célula es interceptada por un laser de una determinada longitud de onda, y la señal de dispersión de luz y fluorescencia emitida por la célula a diferentes longitudes de onda es colectada por el citómetro. La fluorescencia emitida por la célula puede provenir ya sea de la autofluorescencia de los pigmentos fotosintéticos como así también de tinciones con fluorocromos (e.g. SybrGreen). Los citómetros más comunes colectan usualmente seis parámetros diferentes: dos mediciones de dispersión y cuatro de fluorescencia. Esta información multiparamétrica es usualmente visualizada en gráficos de dispersión denominados citogramas, donde se identifican los diferentes microorganismos. La topología de los citogramas varía ente las muestras dependiendo de la composición taxonómica de los microorganismos, y de la morfología y estado fisiológico de las células. El grado de complejidad de los citogramas puede estimarse y se denomina diversidad citométrica (alfa),. Asimismo, también puede estimarse el grado de similitud entre citogramas (diversidad citométrica beta). En el presente trabajo se revisan diferentes ejemplos en donde las estimaciones de diversidad citmétrica alfa y beta permitieron identificar patrones ecológicos relevantes. Se discuten además las diferentes aproximaciones existentes hasta el presente.