Citometría de flujo y secuenciación: combinando herramientas para el estudio de la diversidad de microorganismos acuáticos no cultivables

UNREIN, F.

Congreso; IX Congreso Argentino de Limnología; 2021

Los microorganismos juegan un papel determinante en los ciclos biogeoquímicos de lossistemas acuáticos. En particular el picoplancton, aquellos menores a 2 μm, son losorganismos más abundantes de los ecosistemas y un componente fundamental dentro delas tramas tróficas de los lagos y océanos. Durante las últimas décadas, el desarrollo detécnicas basadas en tinciones fluorescentes, como la microscopía de epifluorescencia y lacitometría de flujo, permitieron demostrar entre otras cosas que la abundancia de bacteriasera varios órdenes de magnitud más elevada de lo que se podía estimar en crecimiento porplaca. Esto generó, un cambio de paradigma en el conocimiento acerca de la estructura delas tramas tróficas acuáticas. La incorporación de técnicas de biología molecular a laecología acuática asimismo revolucionó el conocimiento que se tenía de la diversidad demicroorganismos. Los primeros trabajos de clonado de muestras ambientales de los genesADNr 16S y 18S, para procariotas y eucariotas respectivamente, revelaron la existencia deuna enorme diversidad de microorganismos, muchos de los cuales eran completamentedesconocidos para la ciencia hasta ese momento. La aparición durante la última década detécnicas de secuenciación masiva está generando un avance exponencial en los estudios dediversidad y filogenia de microorganismos acuáticos. Actualmente, la combinación de estastécnicas con la capacidad de separación celular o sorting de la citometría de flujo representauna herramienta sumamente poderosa y promisoria que permite vincular de manera directala diversidad morfológica con la diversidad molecular.