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Los principales ríos y arroyos que atraviesan el AMBA se encuentran muy modificados, presentando un alto grado de deterioro del hábitat. Estudios previos han evidenciado el rol estructurante que posee la comunidad de macrófitas en los arroyos pampeanos. En este contexto, el objetivo general de este trabajo fue evaluar el efecto de la re-introducción de macrófitas sobre la estructura de la comunidad fitoplanctónica como un indicador temprano de cambios tróficos en el ecosistema. Se llevó a cabo una intervención in-situ en un tramo de 200m del Arroyo San Francisco (Claypole, Buenos Aires), en la primavera-verano de los años 2016-2017, consistente en el manejo de la vegetación riparia y la re-introducción de macrófitas nativas arraigadas de lámina flotante. Se monitoreó mensualmente la vegetación acuática y se realizaron muestreos de la columna de agua a partir de un diseño BACI (Before-After/Control-Impact), considerando el tramo intervenido (ZI) y 2 tramos control (ZC), antes y después de la intervención. Los resultados obtenidos muestran un aumento sostenido diferencial de la riqueza de macrófitas acuáticas en ZI, aunque sin observarse un efecto significativo sobre la cobertura media de macrófitas. Luego de 2 meses de finalizada la intervención, se alcanzó un 57% de supervivencia total de los trasplantes, registrándose zonas con mayor supervivencia de los mismos. Respecto a la comunidad fitoplanctónica, si bien no se detectó un efecto significativo de la intervención sobre la abundancia total del fitoplancton, se observó la aparición de crisofíceas posterior a la misma únicamente en ZI, junto a una disminución en la abundancia de euglenoideos en ZI respecto a los tramos control. En ese sentido, estos resultados sugieren un efecto positivo de la re-introducción de macrófitas en el arroyo evidenciado por los cambios en la estructura del fitoplancton.