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Alrededor del mundo existen numerosas especies de aves con poblaciones pequeñas constituidas por un número reducido de parejas reproductivas. Algunas veces, este escenario ocurre naturalmente (ej. Adaptadas a hábitats muy escasos y particulares) mientras que en muchos otros casos es consecuencia de efectos antrópicos como la destrucción del hábitat, la contaminación, la introducción de especies exoticas, etc. Para que dichas poblaciones se mantengan se vuelven necesarios esfuerzos para su conservación con el fin de reclutar nuevos individuos. Sin embargo, muchas veces pasa inadvertido que estas poblaciones pequeñas son a la vez afectadas por enfermedades o parásitos cuyos efectos pueden ser devastadores. Aquí revisamos los efectos conocidos de la mosca parásita e del género Philornis en especies amenazadas de la región Neotropical. Inicialmente, presentamos el efecto que tuvo la introducción de Philornis downsi en las poblaciones de aves terrestres de las Islas Galápagos; enfatizando el caso del Pinzón de Manglar (Camarhynchus heliobates) del cual quedan entre 50-80 individuos. Luego, presentamos datos del parasitismo en poblaciones del Gavilán de la Española (Buteo ridgwayi , 300 a 350 individuos) por Philornis pici en República Dominicana, en el Gavilán de la Sierra de Puerto Rico (Accipiter striatus vennator, < 100 individuos) y finalmente, presentamos datos de las especies de aves hospedadoras de Philornis en Argentina, con particular énfasis en especies con poblaciones reducidas como la del Cardenal Amarillo (Gubernatrix cristata, 1500 a 3000 individuos). La información presentada pone en evidencia que el parasitismo de Philornis puede empeorar notoriamente el estatus poblacional de diversas especies de aves con poblaciones reducidas alrededor del mundo. Por lo mencionado es que se vuelve relevante comenzar a conocer la importancia de este tipo de parasitismo en las especies de nuestro país, en especial aquellas amenazadas o en peligro.