Variabilidad de los genes APOBEC3G y CUL5 en relación con el tiempo de progresión a SIDA pediátrico

DE MAIO, FEDERICO ANDRÉS; ROCCO, CARLOS; AULICINO, PAULA; MECIKOVSKY, DÉBORA; BOLOGNA, ROSA; SEN, LUISA; MANGANO, ANDREA

Salta, Salta

Congreso; II Congreso Nacional de SIDA (CNS); 2009

Sociedad Argentina Interdisciplinaria de SIDA (SAI SIDA)

Objetivo: APOBEC3G es miembro de una familia de proteínas con actividad antiviral sobre HIV-1. El virus es capaz de contrarrestar este efecto antiviral a través de la proteína accesoria Vif, la cual se une directamente a APOBEC3G. El proceso involucra el reclutamiento de un complejo E3 ligasa específico, la poliubiquitinación de APOBEC3G y su degradación en proteasoma. Una proteína clave para este proceso y con la que Vif interactúa es CUL5. Una asociación entre ciertas variantes genéticas tanto de APOBEC3G como de CUL5 y una progresión a SIDA más rápida ha sido reportada en afroamericanos adultos. Nuestro objetivo fue analizar el efecto de los polimorfismos de nucleótido simple (SNPs) APOBEC3G H186R (AxG, rs8177832) y CUL5 SNP6 (AxG, rs11212495) sobre el tiempo de progresión a SIDA en una cohorte pediátrica.  Materiales y métodos: La población estudiada incluyó 425 pacientes pediátricos perinatalmente infectados nacidos entre los años 1986-1999. La genotipificación para ambos SNPs se realizó mediante ensayos de PCR-RFLP. Las enzimas de restricción empleadas fueron HhaI (APOBEC3G H186R) y NspI (CUL5 SNP6). El ajuste al equilibrio de Hardy-Weinberg se evaluó por la prueba de chi cuadrado de Pearson. Las curvas de tiempo a progresión a SIDA fueron estimadas con el método de Kaplan-Meier. Las diferencias en los tiempos a SIDA entre genotipos se evaluaron por regresión de riesgos proporcionales de Cox.  Resultados: La frecuencia alélica de la variante minoritaria fue de 0.09 para ambos SNPs. Las frecuencias genotípicas para APOBEC3G H186R fueron de AA=81.8%, AG=17.9% y GG=0.3%, en tanto que para CUL5 SNP6 fueron de AA=83.8%, AG=15.0% y GG=1.2%. Las frecuencias genotípicas observadas para ambos SNPs se ajustaron a lo esperado para el equilibrio de Hardy-Weinberg. Las medianas de progresión a SIDA en meses para los genotipos de APOBEC3G H186R fueron AA= 36.7, AG=46.5 y GG=62.6, mientras que para CUL5 SNP6 fueron de AA=37.6, AG=56.6 y GG= 12.9. No se encontró un efecto estadísticamente significativo de ningún SNP sobre el tiempo de progresión a SIDA. Un efecto de la combinación de ambos SNPs tampoco fue detectado. Conclusiones: El presente estudio no muestra evidencias de una asociación entre los SNPs APOBEC3G H186R o CUL5 SNP6 y el tiempo de progresión a SIDA pediátrico en nuestra población de niños infectados. Sin embargo, la baja frecuencia del alelo minoritario para ambos SNPs no permite una evaluación precisa de su posible efecto en homocigosis.