Un mapa de ligamiento para C. cardunculus L. basado en marcadores SRAP, SSR y SNPS.

MARTIN, E.; ACQUAVIVA, E.J.; CRAVERO, V.; PORTIS, E.; SCAGLIONE, D.; LANTERI, S.; COINTRY, E.

Buenos Aires

Congreso; VIII Redbio Argentina; 2011

Cynara cardundulus L. es una especie alógama (2n = 2x = 34), perteneciente a la familia Asteracea, que incluye tres variedades botánicas: C. scolymus (alcaucil o alcachofa), C. altilis (cardo cultivado) y C. sylvestris (cardo silvestre). El desarrollo de mapas de ligamiento genético es fundamental en cualquier especie de importancia económica para establecer asociaciones entre marcadores moleculares y genes que controlan carácteres de interés y así desarrollar estrategias de mejoramiento asistido. Con el objetivo de obtener un mapa de ligamiento para la especie C. cardunculus L., se desarrolló una población F1 segregante, siguiendo la estrategia pseudo-test cross, a partir del cruzamiento entre un genotipo de cardo silvestre y un genotipo de alcaucil del tipo varietal “Estrella del Sur FCA”.  La población de mapeo y ambos progenitores fueron evaluados fenotípicamente y mediante marcadores SRAP (Sequence-Related Amplified Polymorphism), SSR (Simple Sequence Repeat) y SNPs (Single Nucleotide Polymorphism). El análisis estadístico de los marcadores se realizó con el programa JoinMap v4, obteniéndose 304 marcadores que presentaron segregación no distorsionada (χ2α=0.1< χ2≤ χ2α=0.01). Con estos marcadores, se construyeron los grupos de ligamiento (LG, linkage group), LODmin=4. Los mapas generados permitieron identificar 15 LG mayores (que incluyen 4 o más marcadores) en el cardo silvestre y 10 LG en el alcaucil. El alineamiento de ambos mapas generó un total de 17 LG mayores y 3 LG menores (2/3 marcadores) para la especie. La longitud total del mapa del cardo silvestre fue de 988,09 cM y del alcaucil fue de 578,193 cM. El carácter “espinosidad en capítulo” fue localizado en el LG 7, “espinosidad en hojas” en el LG 1 y “coloración del capítulo” en el LG 14.