Análisis Informático de Secuencias Moleculares

PANIEGO, N.; HEINZ, R.A.; FERNANDEZ, P.; LEW., S.; HOPP, H.E.

Biotecnología y Mejoramiento Vegetal

INTA

Lugar: Ciudad Autonoma de Buenos Aires; Año: 2004; p. 239 - 254

La Bioinformática es el área de las ciencias de la computación que aborda la búsqueda de soluciones a los problemas biológicos con herramientas computacionales. Tanto el análisis genómico como sus disciplinas relacionadas pueden ser abordados desde una perspectiva diferente a partir de la enorme disponibilidad de secuencias moleculares acumuladas en las bases de datos internacionales como GenBank [1], EMBL [2], DDBJ [3] y SwissProt [4]. El impacto de los proyectos genómicos durante los últimos 10 años, ha sido por un lado la creciente disponibilidad de secuencias, y por el otro la gran diversidad de datos biológicos acumulados. Esto, junto con el desarrollo de las tecnologías informáticas y el arribo de Internet transformando la estructura de almacenamiento y acceso de los datos, ha permitido el desarrollo de aspectos fundamentales para el avance de los conocimientos sobre los sistemas biológicos, como lo son la búsqueda de similitud en secuencias moleculares, el análisis comparativo (filogenético, taxonómico y sinténico) de las especies, el análisis de macromoléculas, la ingeniería y diseño de estructuras proteicas, entre otros [5]. El propósito de este capítulo es introducir los conceptos y las herramientas básicas de la Bioinformática a los estudiantes de un curso de biotecnología vegetal o de biología molecular de plantas. De ninguna manera este material pretende cubrir la totalidad de los recursos existentes para la materia, por el contrario el objetivo es guiar el interés de los estudiantes en la exploración y el uso de métodos computacionales decisivos para el desarrollo de su actividad científica o profesional futura. Por lo cual, en primer lugar describiremos las bases de datos generales para secuencias de ADN y proteínas y las bases de datos específicas de plantas remitiendo en cada caso al estudiante a visitar las paginas principales de los sitios mencionados para ampliar el conocimiento de los mismos. Posteriormente, con la misma orientación abordaremos aspectos relacionados a la búsqueda, el análisis y la interpretación de secuencias biológicas.