Topología del genoma y regulación génica en células de endometrio.

SARAGÜETA, PATRICIA

Seminario; Seminario DFBMC-IFIBYNE; 2018

DFBMC-IFIBYNE

Topología del genoma y regulación génica en células de endometrio. Las hormonas ováricas estrógeno (E2) y progesterona (Pg) actúan a través de sus respectivos receptores ER y PR, factores de transcripción (TF) clave en la fisiología de órganos como la mama y el endometrio. Su desregulación es determinante en el desarrollo y la progresión de los cánceres hormono-dependientes de dichos órganos. En nuestro laboratorio estudiamos los mecanismos por los cuales estas hormonas modifican la expresión génica en células de cáncer endometrial (línea celular Ishikawa) versus células de cáncer de mama (líneas celulares MCF7 y T47D). Mediante análisis de RNAseq encontramos diferencias en el conjunto de genes regulados, que también son parte de diferentes vías fisiológicas. Los sitios de unión de ER y PR al genoma de estas células fueron identificados mediante inmunoprecipitación de la cromatina seguida de secuenciación masiva (ChIPseq). El análisis de estos experimentos nos mostró que la distribución de los sitios de unión de ER y PR también son diferentes y que casi la mitad de ellos son específicos del tipo celular. Estos sitios están enriquecidos en motivos de unión para diferentes TF. El comportamiento diferencial de los receptores hormonales también podría ser causado por diferencias específicas en la topología del genoma y la estructura de la cromatina de las células, la cual exploramos por abordajes basados en técnicas 3C (chromosomal conformation capture) en particular la tecnología de HiC (high-throughput chromosomal conformation capture) la cual permite calcular la frecuencia de contactos globales determinados por la estructura 3D del genoma. Por otro lado, aunque la respuesta de las células cancerosas a la progesterona es transitoria, las células del estroma endometrial en condiciones fisiológicas responden a la progesterona con una trans-diferenciación estable en células deciduales. Queremos estudiar si esta diferencia podría ser la consecuencia de cambios más estables en la topología del genoma de las células del estroma endometrial, en comparación con las células cancerosas.