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Solanum arcanum es una especie silvestre de tomate endémica de los valles interandinos del norte del Perú, donde crece en laderas secas, lomas y embanques de los ríos, entre los 100 m s. n. m. hasta 2900 m s. n. m., distribuyéndose en cuatro regiones naturales. Esta especie junto con S. neorickii y S. chmielewskii forman parte del Grupo Arcanum, filogenéticamente más relacionado con el Grupo Lycopersicon que incluye a la especie de tomate cultivado (S. lycopersicum). El interés por comprender la diversidad de Solanum arcanum se orienta a la conservación de los recursos genéticos. Esta especie es muy variable en su rango de distribución y se han propuesto cuatro morfotipos o ensambles asociados a diferentes regiones geográficas: Marañón, Humifusum, Chotano, Lomas. Se realizó un análisis ecogeográfico para identificar los rangos adaptativos de la especie y las variables ambientales más relevantes que explican sus patrones de distribución real. La identificación y relación de las variables climáticas, bioclimáticas y edáficas fue determinada por el análisis de correlación canónica, y se establecieron las más significativas por análisis estadístico de los datos del Sistema de Información Ambiental. Se describen los morfotipos y su distribución en relación a los descriptores ambientales. Este enfoque tiene aplicaciones promisorias para la conservación de los recursos genéticos de valor relacionados con uno de los cultivos más importantes.

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