Variabilidad de cepas de campo del virus Junín

STEPHAN, B.I.; GOÑI, S.E.; ISERTE, J.A.; CONTIGIANI, M.S.; TENORIO, A.; LOZANO, M.E.

Buenos Aires

Congreso; X Congreso Argentino de Virología; 2011

Sociedad Argentina de Virología - Asociación Argentina de Microbiología

El arenavirus Junín (JUNV) es un virus envuelto de genoma ARN bisegmentado. Ambas moléculas de ARN poseen dos marcos de lectura abiertos no superpuestos y de polaridades opuestas. El ARN genómico mayor posee aprox. 7 kb, es denominado L (de large), y codifica para la proteína L, con actividad transcriptasa dependiente de ARN, y la proteína Z. El segmento menor posee aprox. 3,5 kb, es denominado S (de Small), y codifica para la nucleoproteína (N) y para el precursor de las glicoproteínas virales (GPC). La creciente disponibilidad de secuencias nucleotídicas permite alcanzar un mejor entendimiento de la taxonomía y evolución de esta familia viral. Para JUNV existen datos de secuencia de varias cepas, como las cepas del linaje vacunal (XJ13, XJ#44, Candid#1), MC2 (aislada de un roedor) e IV4454 (aislada de un caso humano). En el presente trabajo se obtuvo y analizó información de secuencia de los genomas de 13 aislamientos virales obtenidos de muestras de roedores y humanos. Trabajos previos de nuestro grupo habían identificado regiones genómicas que presentan variabilidad entre las cepas conocidas, flanqueadas por zonas altamente conservadas. Se seleccionaron dos de estas regiones como blancos para una RT-PCR anidada que fue realizada sobre los ADNc de los 13 aislamientos virales antes mencionados. Las secuencias obtenidas por esta metodología fueron traducidas in silico y alineadas con cepas previamente secuenciadas. A partir de estos datos se realizaron análisis de variabilidad, filogenia y distancia evolutiva. Se realizaron los análisis filogenéticos para todas las muestras en conjunto y para los grupos de muestras de roedores y humanos por separado. Además, se analizó la distancia evolutiva entre diferentes especies de arenavirus para los que existe un número de secuencias significativo. Para ello, se usaron dos arenavirus del nuevo mundo (JUNV y MACV) y dos del viejo mundo (LASV y LCMV). La distancia evolutiva resultó menor para los virus del nuevo mundo que para los del viejo mundo, probablemente debido a la historia evolutiva de esta familia viral. Por lo mismo, esta diferencia estaría ligada con la antigüedad de los virus así como también con su distribución geográfica. Además, este trabajo mostró que existe una gran homogeneidad en secuencia de JUNV en la naturaleza. Los agrupamientos encontrados para aislamientos de JUNV provenientes de roedores son consistentes con una relación evolutiva a partir de un ancestro común.