Contrasting histories of three gene regions asociated with In(3L)Payne of Drosophila melanogaster

HASSON, E., W. EANES

GENETICS

GENETICS SOC AM

Año: 1996 vol. 144 p. 1565 - 1575

0016-6731

In  the  present  report, we  studied  nucleotide  variation  in  three  gene  regions  of Drosophila melanogaster, spanning >5 kb  and  showing different  degrees of  association  with  the  cosmopolitan  inversion  In(3L)Payne.  The analysis  of  sequence  variation  in  the  regions  surrounding  the breakpoints  and  the  heat shock 83  (Hsp83) gene  locus,  located  close  to  the  distal  breakpoint,  revealed  the  absence  of  shared polymorphisms  and  the  presence  of  a number of  fixed  differences between  arrangements,  indicating absence of  genetic  exchange.  In  contrast,  for  the  esterase-6  gene  region,  located  in  the  center  of  the inversion,  we observed  the  presence  of shared  polymorphisms  between  arrangements  suggesting  genetic exchange.  In  the  regions  close  to  the  breakpoints,  the  common  St  arrangement  is  10  times  more polymorphic  than  inverted  chromosomes.  We propose  that  the  lack of recombination  between  arrangements  in  these  regions  coupled  with genetic  hitchhiking  is the  best  explanation  for the low heterozygosity observed in inverted  lines.  Using  the  data  for  the  breakpoints, we estimate  that  this  inversion polymorphism  is  around 0.36 million  yr  old.  Although  it  is widely  accepted  that  inversions  are  examples of balanced  polymorphisms,  none  of  the  current neutrality  tests  including  our Monte  Carlo  simulations showed  significant  departure from  neutral  expectations.