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Se estudió la composición bioquímica (carbohidratos (CH) y proteínas (Pr)) y elemental de la materia orgánica particulada (MOP) en el sistema estuarino, El Rincón (39°S-41°S), durante el periodo Octubre de 2010. Se eligieron 27 estaciones a fin de caracterizar la zona. De acuerdo con la características hidrológicas, físicas (temperatura y salinidad), y bioquímicas (Pr, CH, Clorofila-a (Clo), carbono orgánico particulado (COP), nitrógeno orgánico particulado (NOP)) y antecedentes bibliográficos, dicha zona se dividió en 3 subsistemas (1. zona costera, 2. Frente salino, 3. Plataforma media). Aparentemente las concentraciones de material particulado en suspensión (MPS) estuvieron condicionadas por las condiciones físicas y por los aportes terrestres, y fenómenos de resuspensión, predominando el subsistema costero con un alto contenido promedio de seston (22,18±5,93) mg.L-1. Se observo una notable contribución de carbohidratos superior a la de las proteínas al COP, con valores variables entre 7 y 92% para los carbohidratos y 1 y 51% para las proteínas en toda el área de estudio. El MOP-C (Pr-C + CH-C), y COP correlacionaron significativamente (r=0,87, n=25, ˂0,001). Según algunos estudios realizados en la región, esta es un sistema de producción predominantemente dependiente de la regeneración de nutrientes con el nitrógeno inorgánico como factor limitante, esto hace que posiblemente exista un proceso de remineralización de MOP en el cual los organismos heterótrofos se ven impulsados a utilizar in-situ el nitrógeno orgánico. Los tres sistemas presentaron una predominancia general de la fracción detrítica heterotrófica con un aporte a POC de 41%. Por lo tanto desde el punto de vista biogeoquímico, se logro estimar y distinguir entre los componentes lábiles y refractarios de POM.