Metagenómica de ambientes costeros fríos antárticos y subantárticos

ESPÍNOLA, F.; DIONISI, HEBE M.; MAC CORMACK, W.; JANSSON, JANET; LOZADA, MARIANA

Buenos Aires

Congreso; Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental; 2015

Asociación Argentina de Microbiología

Los microorganismos ambientales habitan en comunidades altamente complejas e interdependientes, las cuales llevan a cabo múltiples procesos esenciales para el ecosistema. La metagenómica constituye una poderosa herramienta para el acceso a las posibles funciones metabólicas de las comunidades microbianas, dada la imposibilidad de cultivar la gran mayoría de sus miembros. El objetivo de este trabajo fue analizar el potencial metabólico de las comunidades microbianas de ambientes marino-costeros fríos (Bahía Ushuaia, Tierra del Fuego, Argentina, ARG; y Caleta Potter, Isla 25 de Mayo, Península Antártica, ANT), y su relación con variables ambientales naturales y antropogénicas. Para ello, se analizaron datos de secuenciación al azar en gran escala del metagenoma de 12 muestras de sedimento (6 de ARG, y 6 de ANT) secuenciados con la plataforma Illumina HiSeq 1500 con una profundidad de una calle por muestra. Se generaron 2,70 ± 0,84 x 108 lecturas por muestra (2 x 150 pb), las cuales fueron ensambladas, y anotadas en la plataforma IMG/M (http://img.jgi.doe.gov/m/). El set de datos contiene 5,82 ± 2,14 x 107 secuencias codificantes de proteínas (CDS) en los metagenomas totales (ensamblados y no ensamblados). Sólo 4,5% a 29,2% de las lecturas mapearon en los scaffolds, evidenciando la extrema complejidad de estas comunidades. Se observó una mayor abundancia (Kruskal-Wallis, p