Identificación de cepas degradadoras de hidrocarburos en aguas de la Bahía de Samborombón y análisis de genes catabólicos

IZZO, S. A.; DIONISI, H. M.; HOZBOR, C.; COSTAGLIOLA, M.; PERESSUTTI, S.

Buenos Aires

Congreso; XIII Congreso Argentino de Microbiología y II Congreso Microbiología Agrícola y Ambiental; 2013

Asociación Argentina de Microbiología

La Bahía de Samborombón representa un ambiente de gran importancia para eldesarrollo de los stocks pesqueros de especies costeras que utilizan la zona comoárea de reproducción y cría. Este sistema se encuentra expuesto a la poluciónpor hidrocarburos provenientes del Río de la Plata, asociados principalmentea la actividad industrial y portuaria, que producen efectos tóxicos sobre pecesy otros organismos acuáticos. El objetivo de este trabajo fue identificar pormedio de técnicas dependientes de cultivo, cepas bacterianas con capacidadde crecer en presencia de hidrocarburos y predecir su potencial degradativoa partir de la detección de genes que codifican enzimas involucradas en víascatabólicas. Se colectaron muestras de agua superficial en 10 estaciones demuestreo ubicadas a lo largo de un gradiente mixohalino durante dos campañasde investigación del INIDEP realizadas en abril de 2011 y mayo de 2012. Paracada estación se midieron parámetros ambientales (clorofila a: 1,5 a 4,2 µg/l;material particulado en suspensión: 16,1 a 65,6 mg/l; material particuladoorgánico: 1,8 a 5,3 mg/l; porcentaje de materia orgánica: 3,96 a 21,98; salinidad:20,01 a 31,5; temperatura 14,9 a 21,8°C y oxígeno disuelto: 5,9 a 7,9 mg/) y serealizaron aislamientos bacterianos en medio mineral salino suplementado congasoil, fenantreno o antraceno. Se aislaron 47 cepas que fueron analizadas porRFLP (Polimorfismo del Largo de los Fragmentos de Restricción) del gen ARNr16S, resultando en 35 patrones únicos. Estos aislamientos se identificaronfilogenéticamente mediante secuenciación del gen ARNr 16S y análisis BLAST, yse asignaron a los siguientes filotipos con un valor de similitud mayor al 97%:Acinetobacter sp., Cobetia sp., Dietzia sp., Halomonas sp., Marinomonas sp.,Microbacterium sp., Micrococcus sp., Mycobacterium sp., Pseudoalteromonassp., Pseudomonas sp., Psychrobacter sp., Rhodococcus sp., Rhizobium sp.,Sphingomonas sp. y Vibrios sp. Las cepas fueron estudiadas en cuanto a sucapacidad de crecer frente a diversos hidrocarburos. El 90% de las mismascrecieron con pentadecano y hexadecano, mientras que entre el 30 y el 40% lohicieron con naftaleno, antraceno, fenantreno y fenildecano. Para cada unade las cepas identificadas se estudió la presencia de genes que codifican paramonoxigenasas de alcanos y dioxigenasas de poliaromáticos, utilizando loscebadores AlkB484F-AlkB824R y Ac114F-Ac596R, respectivamente. Se detectóamplificación positiva en 18 aislamientos para monoxigenasas y en 27 paradioxigenasas. Estos genes serán analizados filogenéticamente con el fin deaportar conocimientos sobre marcadores funcionales en el ambiente en estudio.La diversidad taxonómica encontrada, mediante técnicas dependientes decultivo, así como la detección de genes catabólicos constituyen una potencialherramienta biotecnológica de relevancia en la biorremediación de esta zona.