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La tipificación de ADN se ha convertido en un estándar internacional para la identificación individual y la verificación de paternidad en las razas de caballos domésticos. Las metodologías utilizadas consisten en sistemas multiplexes de microsatélites, estandarizados en Tests de Comparación bianuales de la Sociedad Internacional de Genética Animal (ISAG). La utilidad de estos sistemas ha trascendido la identificación individual y su aplicación ha permitido la resolución de casos forenses. Además, la automatización de los procedimientos de laboratorio ha permitido maximizar las rutinas experimentales. El objetivo del presente trabajo consistió en evaluar el poder de resolución del set de marcadores recomendados en casos de identificación individual, asignación de paternidades y maternidades dudosas, robo o cambio de productos y doping, recibidos en el laboratorio. El ADN se purificó a partir de diferentes muestras biológicas (sangre, semen, bulbos pilosos u orina) utilizando los métodos optimizados para cada caso. La genotipificación de los loci microsatélites recomendados por la ISAG se realizo en secuenciador automático MegaBACE1000 usando el marcador de peso molecular ET-Rox 550. El análisis y asignación de genotipos se realizó con el programa Genetic Profiler Software Suit v2.2. La lectura se estandarizó con ADNs de referencia del Test Internacional de Comparación de la ISAG. En cada caso analizado, se calcularon los parámetros poblacionales y el poder de exclusión de cada marcador y del set completo. Se discute la posibilidad de utilizar sistemas adicionales para identificación en casos de individuos relacionados, tales como juegos alternativos de microsatélites, SNPs y/o marcadores diagnósticos (Ej. pelaje).

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