LA PERSPECTIVA BIOINFORMÁTICA DE LA BIOSÍNTESIS DE FLAVONOIDES EN PLANTAS: ANÁLISIS BIOCOMPUTACIONAL DE GRANDES CANTIDADES DE SECUENCIAS Y APLICACIÓN EN BIOLOGÍA DE SISTEMAS

VALIÑAS M; BONDINO H; LANTERI M.L.; ANDREU A.B.; TEN HAVE A.

Mar del Plata

Congreso; VIII ENCUENTRO PARA LATINO AMÉRICA Y EL CARIBE DE BIOTECNOLOGÍA. REDBIO Argentina 2013. WORKSHOP: "Agrobiodiversidad Andina: Base de la Seguridad Alimentaria"; 2013

INTA y REDBIO

La biología se encuentra en la fase de ?Big Data?, es decir, existe disponibilidad de muchas secuencias y otros datos genómicos. Para aprovechar esta situación tenemos que intensificar el estudio computacional. Dos ejemplos donde la biología y la genómica computacional se encuentran son la Predicción Estructura-Función (SFP) y la Biología de Sistemas (BS). En el estudio de la regulación metabólica de la red biosintética de flavonoides en papa usamos SFP para la caracterización de aspectos funcionales de las proteínas que pertenecen a una superfamilia. La red contiene varias enzimas que pertenecen a superfamilias como las UDP-Glicosíl Transferasas (100 isoformas en el proteoma completo). Con diversas técnicas se identifican cuáles isoformas pertenecen al metabolismo de flavonoides. Para otras enzimas el interés está dirigido a la especificidad de sustrato. Discutiremos algunos ejemplos. La BS se puede aplicar al estudio de la regulación metabólica basado en un modelo cinético de la red. Dada la alta complejidad de la red se simplifica en un modelo cinético con solo seis enzimas. Usando varios modelos matemáticos y datos obtenidos en el wetlab se ensayará y mejorará el modelo. En un siguiente paso se llevarán a cabo experimentos dedicados a la pertubación del sistema.