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La electroforesis capilar permite la enantioseparación de complejos formados a partir del enantiómero R y S de un compuesto quiral en presencia del selector quiral, estos complejos se generan a través de reacciones químicas gobernadas por las constantes de binding. Mediante un proceso fisicoquímico estos enantiómeros pueden ser separados. Analizamos este problema con un modelo simple de simulación, en principio se ha tenido en cuenta los mecanismos que se suponen son lo más importantes de este fenómeno. Usando probabilidades de transición tipo Metropolis, se ha analizado el comportamiento de la enantioseparación debido a los siguientes efectos: Relación entre las constantes de binding de los complejos, fricción de los complejos, relación entre las velocidades de migración de los enantiómeros (R y S) y finalmente de la temperatura. Los resultados obtenidos concuerdan cualitativamente bien con resultados experimentales de la bibliografía existente.