Mapeo por Asociación para el estudio de la resistencia a Sclerotinia sclerotiorum en girasol

FILIPPI C.; AGUIRRE N.; ZUBRZYCKI J.; CORDES D.; RIVAS J.G.; MARINGOLO C.; PUEBLA A.; QUIROZ F.; ALVAREZ D.; HOPP H.E.; ESCANDE A.; HEINZ R.A.; LIA V.V.; PANIEGO N.

Congreso; XLIII Congreso Argentino de Genética; 2014

Sociedad Argentina de Genetica

El mapeo por asociación (MA) es un método de mapeo de QTL que tiene el potencial de alcanzar resolución a nivel de genes individuales implicados en características cuantitativas complejas. En contraste con el mapeo biparental clásico de QTL, los métodos de MA pueden detectar relaciones entre variaciones fenotípicas y polimorfismos génicos existentes en colecciones de germoplasma, sin la necesidad del desarrollo de poblaciones de mapeo. Este trabajo tiene por objetivo la identificación de genes involucrados en la defensa a la podredumbre húmeda del capítulo (PHC) causada por Sclerotinia sclerotiorum utilizando la estrategia de MA basada en el análisis de genes candidato. Un conjunto de 137 líneas endocriadas de girasol fueron genotipificadas con un panel de 384 SNPs basado en la tecnología Golden Gate/Veracode (Illumina) y un conjunto de 30 genes candidato (GC) seleccionados por su participación en procesos de defensa a S. sclerotiorum en estudios de expresión diferencial. Se determinó la presencia de estructura genética en la población utilizando un panel de 42 SSR. Las medidas fenotípicas evaluadas fueron incidencia y severidad de la enfermedad registradas durante cinco campañas (2009-2014) y utilizando inoculación asistida con esporas del hongo. Análisis estadísticos llevados a cabo utilizando el software TASSEL permitieron la identificación de 4 GC relacionados con reducción en la incidencia de PHC y uno relacionado con menor severidad a través de la estrategia de MA (p