Analisis de diversidad genetica y estructura poblacional para estudios de asociacion en girasol

FILIPPI C.; RIVAS J.G.; HEINZ R.A.; HOPP H.E.; MORENO M.V.; CORDES D.; ALVAREZ D.; PANIEGO N.; LIA V.V.

Salta

Congreso; XLII Congreso Argentino de Genetica y III Reunion Regional SAG-NOA; 2013

Sociedad Argentina de Genetica

El mapeo por asociacion es una estrategia alternativa al mapeo biparental de QTL, ya que hace uso de los eventos de recombinacion historicos y de la diversidad nucleotidica  presentes en lineas y poblaciones naturales para encontrar variantes alelicas causales de caracteres complejos. El presente trabajo tiene por objeto (a) examinar la estructura poblacional y la diversidad gen¨¦tica presentes en la Poblacion de Mapeo por Asociacion (PMA) del programa de mejoramiento de girasol de INTA  mediante el uso de marcadores SSR; y (b) comparar dichos resultados con los obtenidos usando marcadores funcionales de tipo SNP. Con este fin, 141 lineas endocriadas de girasol pertenecientes al Banco Activo de Germoplasma de INTA Manfredi fueron genotipificadas con 42 SSR y un panel de 384 SNPs. La caracterizaci¨®n de la PMA evidencio  una gran diversidad molecular entre las lineas seleccionadas. La heterocigosis esperada y la diversidad genica fueron mayores para los loci SSR que para los SNPs. Las estimas de distancia genica calculadas usando los dos sistemas mostraron correlacion significativa. La caracterizacion de la estructura poblacional y diversidad genetica presentes en la PMA constituye una herramienta fundamental para el futuro desarrollo de estudios de asociacion  para caracteres complejos en girasol.