ANÁLISIS DE LOS PERFILES DE EXPRESIÓN GÉNICA DE GIRASOL EN RESPUESTA AL PATÓGENO SCLEROTINIA SCLEROTIORUM

EHRENBOLGER F.; FASS M.; PELUFFO L.; DI RIENZO J.; LIA V.V.; HOPP H.E.; PANIEGO N.; HEINZ R.A.

Congreso; VIII Encuentro Latinoamericano y del Caribe de Biotecnología REDBIO 2013; 2013

La podredumbre húmeda del capítulo (PHC) causada por el hongo necrotrófico Sclerotinia sclerotiorum es una de las principales limitantes en la producción de girasol. La resistencia a este patógeno es multigénica por lo que la identificación de genes candidatos asociados a resistencia es crucial para el mejoramiento del cultivo. En este trabajo se abordó la identificación de nuevos genes candidatos a través del análisis de perfiles de expresión utilizando un microarreglo de formato Agilent Technology generado a partir de colecciones públicas y privadas de ESTs de girasol, compuesto por un total de 40.169 sondas derivadas de unigenes. Para ello, se sembraron las líneas públicas endocriadas HA89 (susceptible), HA853 y RK416 (moderadamente resistentes), y  se cosecharon capítulos inoculados con el patógeno y sus respectivos controles a 0, 4 y 8 días post inoculación. Mediante esta estrategia se hallaron 1000 secuencias diferencialmente expresadas entre los tratamientos, seleccionándose un subconjunto de 60 genes para validar su comportamiento a través de qRT-PCR. La identificación y validación de nuevos genes candidatos derivados de distintas fuentes de resistencia permitirá contribuir al conocimiento de los mecanismos de defensa involucrados así como al desarrollo de herramientas útiles para el mejoramiento asistido del cultivo.