Desarrollo de marcadores microsatélites (SSR) a partir de lecturas de ddRAD-seq en el complejo taxonómico Mimosa ramulosa – M. tandilensis (Fabaceae: Caesalpinioideae, Sección Mimosa Subserie Obstrigosae)

CALDERON, F.; GUTIERREZ, A.V.; LIA, V.V.; FORTUNATO, R.H:; MORALES, M.

Congreso; XXXVIII Jornadas Argentinas de Botánica; 2021

Mimosa ramulosa y M. tandilensis son especies nativas de Argentina, Brasil y Uruguay. Según la bibliografía, estas entidades pueden diferenciarse por el porte de los individuos, característica difícil de dilucidar a partir de ejemplares de herbario. La baja diferenciación morfológica entre ambas especies mediada por otros caracteres vegetativos y reproductivos determina que forman un complejo taxonómico. Adicionalmente, no se dispone de información acerca de la diferenciación genética de este grupo ni de marcadores moleculares específicos para evaluarla. En este ensayo se identificaron marcadores microsatélites a partir de lecturas obtenidas mediante una técnica de genotipado por secuenciación (ddRAD-seq). Dos individuos, uno de cada especie, fueron seleccionados para la extracción de ADN y desarrollo de la biblioteca genómica. Las lecturas obtenidas de la secuenciación (250 SE) fueron procesadas en el software Stacks, previo a la búsqueda de motivos microsatélites (SSR) y formación de consensos con el software QDDv3. Finalmente, las secuencias obtenidas fueron monitoreadas en el programa BioEdit para descartar posibles parálogos. De 6004758 lecturas obtenidas se retuvieron un total de 256717 lecturas únicas. A partir de las mismas, fueron encontrados 226 SSRs, de los cuales sólo 36 superaron los criterios de selección establecidos para evitar parálogos. Este método ofrece una alternativa para el desarrollo de marcadores en especies no modelo.