Local adaptation in native races of maize from Northern Argentina

GUTIERREZ, A.V.; DOMINGUEZ, P.G.; VERA, P.; DEFACIO, R.; PUEBLA, A.F.; PANIEGO, N.B.; LIA, V.V.

Congreso; XXXVIII Jornadas Argentinas de Botánica; 2021

Las razas de maíz del Norte de Argentina son cultivadas en diversos ambientes, desde planicies hasta más de 3000 m de altura. Esta distribución sugiere fenómenos de adaptación local que pueden ser identificados mediante información genómica, diferenciando factores demográficos de selectivos. Evaluamos datos de secuenciación masiva de 135 individuos de razas nativas del NOA y NEA con el objeto de analizar la estructura poblacional y detectar huellas genéticas de adaptación. Los datos fueron obtenidos a partir de dos ensayos de ddRAD-seq, generados con las enzimas PstI/EcorI (M1, 85 ind) y SphI/MboI (M2, 50 ind). Se utilizó la versión V4 del genoma de referencia, obteniéndose 1770 y 4190 SNPs, respectivamente. Los análisis de agrupamiento mostraron los grupos genéticos previamente reconocidos. Se detectaron diferencias significativas en las medidas de variabilidad (HtM1=0.21-HtM2=0.29) y diferenciación global (GstM1=0.11-GstM2=0.13) que pueden ser adjudicadas a la composición de los individuos y al impacto de los parámetros de filtrado. El porcentaje de marcadores encontrados en regiones génicas (18%-54.8%) e intergénicas (63.1%-16.5%) fue diferente, lo cual podría deberse al par enzimático utilizado. Pudimos detectar 60 loci cuyos patrones de diferenciación no pueden ser explicados por la demografía (Fst outliers). Se realizó una caracterización genética exitosa, resultando la técnica de ddRADseq una alternativa eficiente para identificar genes vinculados a la adaptación local.