Estudio de la relación entre el número medio de cruces y la secuencia de un heteropolímero de dos letras

RIOJAS ROLDAN, HÉCTOR; CARLEVARO, C. MANUEL; VERICAT, FERNANDO

San Rafael, Mendoza

Congreso; V Taller Regional de Física Estadística y Aplicaciones a la Materia Condensada (TREFEMAC 07).; 2007

UTN San Rafael

En esta comunicación consideramos un modelo simple de heteropolímero de dos letras, que nos permite introducirnos en el complicado problema de relaccionar la secuencia de monómeros con la estructura de biopolímeros. En general la dificultad mayor que se presenta al intentar atacar este problema desde un punto de vista computacional, es la enorme cantidad de memoria y tiempo de CPU requeridos, en virtud del gran número de cofiguraciones posibles. En este trabajo intentamos soslayar este inconveniente utilizando, en adición a la simplicidad del modelo, un tratamiento que mezcla métodos analíticos con numéricos. Nuestro modelo de heteropolímero consiste en cuentas en un filamento, siendo éstas de dos tipos posibles indicados con H y P. Por lo tanto, la composición de la cadena se establece fijando N, el número total de cuentas, y Nh, el número de cuentas H. Cada par de cuentas que se encuentran conectadas definen una unión. En consecuencia, nuestro modelo permite la existencia de tres tipos de uniones  (con  H o P), y podemos cuantificar la cantidad de uniones de cada tipo mediante Nhh, Nhp y Npp. Podemos tener una idea del grado de compacidad del polímero a partir del número medio de cruces. Los cruces quedan definidos por pares de uniones. Con la finalidad de hacer más realista el modelo establecemos restricciones sobre los pares de uniones que pueden formar cruces. En particular consideramos un "loop" mínimo.