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La provincia de Chaco, Argentina, presenta una diversidad importante de culturas; está integrada por grupos de nativos americanos propios de esa región y habitantes de las ciudades originadas de la miscegenación con inmigrantes que proceden tanto del continente europeo como de países limítrofes. La diversidad genética de estas poblaciones ha sido intensamente estudiada utilizando marcadores no codificantes, principalmente de herencia uniparental, sin embargo la variación de regiones codificantes, que pueden incidir en la variación fenotípica, no se ha explorado aún en profundidad. Con el objetivo de caracterizar dicha variación, analizamos cinco snp el gen de la catecol-O-metil transferasa (comt) el cual se relaciona con la determinación de fenotipos complejos, como la sensibilidad al dolor. Diversos estudios muestran que dicha sensibilidad es marcadamente diferente entre individuos de distinto origen étnico y continental, aunque no se cuenta con información detallada para las poblaciones americanas.Analizamos tres poblaciones chaqueñas: la capital provincial, Resistencia (n=108), una localidad del Impenetrable chaqueño, Misión Nueva Pompeya (mnp, n=54) y una comunidad nativa Wichí también del Impenetrable (n=27). Los snp se tipificaron por pcr-alelo específica (rs4818) o pcr-rflp (rs740603, rs4633, rs6269 y rs4680). Todos se ajustaron al equilibrio de Hardy-Weinberg, con valores de diversidad génica entre 0,472 (Resistencia) y 0,392 (Wichí). Este último valor respondería a que la comunidad Wichí, por su aislamiento y escasa integración con la comunidad urbana de origen mixto, está sujeta a los efectos de la deriva génica con pérdida de variabilidad. La comparación entre las tres poblaciones resultó en valores de Fst significativos (p

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