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El sistema hidrográfico del río Chubut ocupa el 60% de la superficie provincial (224.686 km²) y exhibe un derrame medio anual de 10 ? 12 km3. Le sigue en importancia el sistema Senguerr-Chico, el cual, antes de atarquinarse en décadas recientes, estaba conectado permanentemente con el Chubut. Los sistemas incluyen los embalses Ameghino y Amutui Quimey, modulantes de los caudales de los ríos Chubut y Futaleufú, respectivamente, los que proveen energía eléctrica y caudal para riego. Un conjunto de lagos oligotróficos cordilleranos (Puelo, Epuyén, Cholila, Rivadavia, Futalaufquen, Menéndez, General Vintter, La Plata y Fontana) de edad cuaternaria y origen glacial, derivan en una serie de cursos de agua que, en su mayoría, desaguan en el Océano Pacífico. El módulo del Chubut en Valle Inferior es de 34,9 ± 14 m3 s-1. El caudal específico es de solo 1,1 L s-1 km-2. El análisis estadístico no paramétrico Kendall estacional muestra, particularmente durante los meses enero, febrero, marzo y mayo, una tendencia decreciente en los caudales estadísticamente significativa (p < 0,05). Las cuencas andinas exhiben una secuencia de abundancia de aniones (HCO3- > SO42-  Cl-) y de cationes (Ca2+ > Na+ > Mg2+ > K+), alterada en la cuenca baja (HCO3- > Cl- > SO42- y Na+ > Ca2+> Mg2+ > K+). El índice TZ+ (meq L-1) = (2Ca2+) + (2Mg2+) + (Na+) + (K+) permite clasificar la mayoría de las aguas del río Chubut en medianamente diluidas y medianamente mineralizadas (1,5 < TZ+ < 3,0 meq L-1). El Senguerr exhibe términos diluidos (TZ+ < 0,3, en el Alto Senguerr) y subsalinos (TZ+ < 24) o salinos (TZ+ > 24) en el río Chico. Correlacionando TZ+ con DA [DA (meq L-1) = (HCO3-) + (2CO32-) / [(HCO3-) + (2CO32-) + (Cl-) + (2SO42-)], es posible identificar diversas fuentes de solutos, como rocas con carbonatos dominantes (valores altos para DA y TZ+) o salares, rocas sedimentarias/aguas subterráneas salinas (DA bajo y TZ+ alto).

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