INVESTIGADORES
GIOVAMBATTISTA Guillermo
convenios, asesorías y/o servicios tecnológicos
Título:
ST 993 Servicio de análisis bioinformático de microarreglos de SNPs
Autor/es:
LIRON J P; ABBA M; MORALES H F; OLIVERA L H; GIOVAMBATTISTA G
Fecha inicio:
2012-11-01
Fecha finalización:
2030-12-01
Campo de Aplicación:
Otros campos
Descripción:
En primera instancia se procede a efectuar los controles de calidad sobre los archivos de genotipificación de SNPs provistos por el usuario del servicio, para luego iniciar la fase de preprocesamiento de datos (ej., MAF, Call rate, desequilibrio de Hardy-Weinberg, estructuración poblacional, etc.) con el fin de filtrar las muestras o SNPs que no cumplan con la condición de corte para su posterior análisis estadístico (asociación alélica, genotípica y haplotipica, caso control, TDT, etc.) que mejor se adapten al diseño experimental. Finalmente, se efectúan las inferencias biológicas en términos de identificación de vías de señalización por ´data mining´ de los genes identificados. El usuario del servicio dispondrá de tres archivos correspondientes a los resultados de cada una de las tres fases del análisis, así como una descripción detallada de las metodologías estadísticas empleadas en el mismo.
