INVESTIGADORES
GIOVAMBATTISTA Guillermo
convenios, asesorías y/o servicios tecnológicos
Título:
ST2334 Microarrays de SNPs de media y alta densidad
Autor/es:
GIOVAMBATTISTA, G.; POSIK D.M.; VILLEGAS CASTAGNASO, E.E.; ZAPPA M.E.
Fecha inicio:
2015-05-01
Fecha finalización:
2030-06-01
Campo de Aplicación:
Produccion animal
Descripción:
El STAN consiste en el análisis de muestras de ADN genómico mediante microarrays de SNPs demediana y alta densidad de tecnología Axion en una plataforma Gen Titan y el posterior procesamiento de los datos crudos.La cantidad y calidad del ADN genómico recibido es medida mediante espectrofotometría yelectroforesis en geles de agaroas. Posteriormente, el ADN es fragmentado mediante DNAasas y amplificado a nivel genómico mediante PCR isotérmico. Una vez verificado el producto de amplificación genómica es hibridado con las sondas fijadas al soporte del microarrays, y después de sucesivos lavados, el producto de hibridación es detectado mediante anticuerpos y escaneado por la plataforma GeNETitan. La imagen capturada es procesada y las muestras y SNPs son filtrados de acuerdo a diferentes parámetros (QC, dQC, call rate) utilizando el software Axiom Analysis Suite. Finalmente, los datos procesados son exportados n diferentes formatos (txt, tped, ped) y enviados al solicitante de la prestación.
