Inferencia de la Red de Regulación Génica de transactivación de la 1--hidroxilasa en células presentadoras de antígenos expuestas a LPS

MARTINELLI, R.; DAURELIO, L.D.; ESTEBAN, L.

Rosario

Congreso; XVI Congreso y XXXIV Reunión Anual de la Sociedad de Biología de Rosario; 2014

Sociedad de Biología de Rosario (SBR)

La 25-hidroxivitamina-D puede ser activada a 1,25-hidroxivitamina-D3 [1,25(OH)2D3] por la enzima 1-a-hidroxilasa. En células del sistema inmune, esta enzima se encuentra bajo el control de estímulos inmunológicos. Por ejemplo en situaciones patológicas, como tuberculosis, esto puede llevar a un aumento sistémico de 1,25(OH)2D3 e hipercalcemia. Existen estudios previos que revelan que el lipopolisacárido (LPS) estimula a la enzima 1-a-hidroxilasa en células inmunes. A pesar de que existen estudios de transactivación de esta enzima en células presentadoras de antígenos (CPA) que estudian los factores de transcripción involucrados, no se han utilizado enfoques de sistema para analizar las interacciones complejas involucradas en su regulación, objetivo del presente trabajo. Los datos de microarreglos utilizados fueron obtenidos en la base de datos GEO, usando "macrophage" y "LPS" como palabras clave de busqueda. Los mismos fueron integrados mediante un meta-análisis con la herramienta INMEX. Se utilizó Benjamini-Hochberg´s False Discovery Rate calcular la expresión diferencial de los genes y método de Fisher para combinar los p-values de múltiples estudios. Luego se realizó el enriquecimiento en Pathways y análisis Go usando test hipergeométrico para obtener información funcional. Se seleccionó una lista de genes diferencialmente expresados enriquecida en un pathway particular y fue alimentada con nombres de proteínas regulatorias y enzimas involucradas en la respuesta a 1-a-hidroxilasa. La lista final fue cargada en el programa Genemania y la red obtenida fue curada y analizada con Cytoscape. En el análisis se observó que el gen de la 1-a-hidroxilasa mapea a la vía de tuberculosis, una asociación clínica que dió uno de los primeros señales de la actividad extra-renal de la enzima. Ademas se detectaron la mayoría de los factores de transcripción descriptos en la literatura que interactúan con el promotor de la 1--hidroxilasa como NFKB1, CREB, STAT1a, C/EBPb y JUN. También se observaron nuevas relaciones funcionales entre otras proteínas como C/EBPb-NFKB y CEBPb-Jun que deberán ser confirmadas con nuevos estudios.