INQUIMAE   12526
INSTITUTO DE QUIMICA, FISICA DE LOS MATERIALES, MEDIOAMBIENTE Y ENERGIA
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Dynamics regulate activity of MAPKs
Autor/es:
FERREIRO, DN; RODRIQUEZ, RG; MARTÍ, MA; TURJANSKI, AG
Lugar:
Ciudad de la Plata
Reunión:
Congreso; Congreso anual de la Sociedad Argentina de Biofisica.; 2008
Institución organizadora:
SAB
Resumen:
<!--
@page { size: 8.5in 11in; margin: 0.79in }
P { margin-bottom: 0.08in }
-->
Las
MAPKs (Mitogen-Activated
Protein Kinases)
son serin/treonin kinasas que fosforilan proteínas con el motivo
S/T-P. El sistema de transducción de señales que es mediado por
MAPKs tiene un rol importante en la regulación de diferentes
procesos celulares incluyendo el crecimiento celular, la
diferenciación, la inflamación y la apoptosis. Para ser activadas,
las MAPKs, requieren una doble fosforilación en dos residuos
altamente conservados, tirosina y treonina. Dentro de las MAPKs, las
p38 son cuatro isoformas, p38α,ß,γ,δ,
cuyo sitio de fosforilación es TGY. Las
MAPKs están compuestas por dos dominios, y entre ambos se encuentra
el sitio catalítico que une una molécula de ATP y dos átomos de
magnesio. El activationloop,
donde se encuentra el motivo TGY,
determina en gran parte la activación de la molécula. Las MAPKs
unen a las MAPKKs, factores de transcripción, proteínas scaffold y
fosfatasas mediante sitios que se encuentran alejados del sitio
catalítico, denominados sitios de docking.
A
pesar del vasto conocimiento que hay sobre la estructura de MAPKs se
sabe poco del mecanismo que regula la activación e interacción con
otras proteínas, ya que las estructuras estáticas son muy
similares. En este trabajo realizamos un estudio computacional usando
técnicas de dinámica molecular clásica donde caracterizamos la
dinámica de la MAPK p38γ
en tres diferentes estados: a) Proteína inactiva, b) Proteína
activa sin ATP y Mg2+
y c) Proteίna
activa con ATP y Mg2+.
Mediante el cálculo de modos normales se observó que un inserto de
dos alfa hélices, presente solamente en la familia de MAPK y que
regularía las interacciones proteína-proteína, es altamente
flexible y su conformación depende del estado activo/inactivo de
p38γ.
Se determinó la dinámica conformacional involucrada en la
activación y se observó que el activation
loop
y los sitios de docking juegan un rol fundamental en las transiciones
conformacionales de p38γ.
Nuestros resultados concuerdan con diversos resultados experimentales
y extienden nuestra comprensión de esta familia de kinasas.