IFIBYNE   05513
INSTITUTO DE FISIOLOGIA, BIOLOGIA MOLECULAR Y NEUROCIENCIAS
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Using enhancer and super-enhancer activity profiles in multiple lines to explore transcriptional perturbations in breast cancer
Autor/es:
ARCUSCHIN CD; MUÑOZ D; SCHOR IE
Lugar:
Buenos Aires
Reunión:
Workshop; Workshop Biología Celular y Molecular del ARN; 2018
Resumen:
<!-- /* Font Definitions */@font-face{font-family:Arial;panose-1:2 11 6 4 2 2 2 2 2 4;mso-font-charset:0;mso-generic-font-family:auto;mso-font-pitch:variable;mso-font-signature:3 0 0 0 1 0;}@font-face{font-family:Times;panose-1:2 0 5 0 0 0 0 0 0 0;mso-font-charset:0;mso-generic-font-family:auto;mso-font-pitch:variable;mso-font-signature:3 0 0 0 1 0;}@font-face{font-family:"MS 明朝";panose-1:0 0 0 0 0 0 0 0 0 0;mso-font-charset:128;mso-generic-font-family:roman;mso-font-format:other;mso-font-pitch:fixed;mso-font-signature:1 134676480 16 0 131072 0;}@font-face{font-family:"Cambria Math";panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;mso-font-charset:0;mso-generic-font-family:auto;mso-font-pitch:variable;mso-font-signature:3 0 0 0 1 0;}@font-face{font-family:Cambria;panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;mso-font-charset:0;mso-generic-font-family:auto;mso-font-pitch:variable;mso-font-signature:3 0 0 0 1 0;} /* Style Definitions */p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal{mso-style-unhide:no;mso-style-qformat:yes;mso-style-parent:"";margin:0cm;margin-bottom:.0001pt;mso-pagination:widow-orphan;font-size:12.0pt;font-family:Cambria;mso-ascii-font-family:Cambria;mso-ascii-theme-font:minor-latin;mso-fareast-font-family:"MS 明朝";mso-fareast-theme-font:minor-fareast;mso-hansi-font-family:Cambria;mso-hansi-theme-font:minor-latin;mso-bidi-font-family:"Times New Roman";mso-bidi-theme-font:minor-bidi;mso-ansi-language:EN-US;}.MsoChpDefault{mso-style-type:export-only;mso-default-props:yes;font-family:Cambria;mso-ascii-font-family:Cambria;mso-ascii-theme-font:minor-latin;mso-fareast-font-family:"MS 明朝";mso-fareast-theme-font:minor-fareast;mso-hansi-font-family:Cambria;mso-hansi-theme-font:minor-latin;mso-bidi-font-family:"Times New Roman";mso-bidi-theme-font:minor-bidi;mso-ansi-language:EN-US;}@page WordSection1{size:595.0pt 842.0pt;margin:72.0pt 90.0pt 72.0pt 90.0pt;mso-header-margin:35.4pt;mso-footer-margin:35.4pt;mso-paper-source:0;}div.WordSection1{page:WordSection1;}-->La identidad y lafunción celular está determinada por redes regulatorias de la expresión génica,cuyo mal funcionamiento puede llevar a patologías como el cáncer. Los enhancersson elementos genéticos claves en éstas redes y la alteración de su funciónpuede estar asociada a desregulación de vías oncogénicas y/o supresoras detumores. A su vez, sabemos que existen regiones regulatorias de gran actividad,o super-enhancers (SE), con importante participación en los procesostumorigénicos.El objetivo de este trabajo es utilizar los perfilesde actividad de enhancers a escala genómica en 18 líneas celulares paraanalizar los cambios transcripcionales que ocurren en diferentes tipos decáncer de mama. Para ello se utilizaron datos de ChIP-seq para H3K27ac, marcatípicamente presente en enhancers activos. A partir de éstos seobtuvieron los picos de señal en cada muestra, que luego fueron combinados enregiones regulatorias y clasificados en enhancers y SE. Luego se realizóun análisis de actividad diferencial agrupando las líneas de acuerdo a susubtipo celular. Esto permite obtener grupos de enhancers y/o SEespecíficamente activos en determinados tipos de tumores. La identificación delos motivos enriquecidos en estas regiones permitirá encontrar nuevas víasregulatorias sobre-activadas en grupos tumorales, abriendo la posibilidad anuevas estrategias de intervención.