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Las antraquinonas (AQ) son un importante grupo de metabolitos secundarios presentes en diversas especies vegetales y constituyen el mayor grupo de quinonas naturales. Nuestro grupo de investigación ha iniciado el estudio químico de la Heterophyllae pustulata Hook (Rubiaceae), una especie vegetal de America del Sur popularmente conocido como "cegadera". Las AQs mayoritarias que se aislaron e identificaron de las partes aéreas de esta planta son: rubiadin, soranjidiol y rubiadin 1-metil-éter [1] y presentan una importante actividad anti-bacterianas, anti-virales y anti-cáncer [1-4]. Debido a las múltiples aplicaciones biológicas de estas AQs y su amplia gama de aplicaciones en la industria farmacéutica, es de gran interés la optimización de los procesos de extracción de estos compuestos. Estos compuestos son generalmente extraídos de la matriz vegetal mediante Soxhlet con sucesivas extracciones de solventes de polaridad creciente, comenzando con hexano, después con benceno, acetato de etilo y finalmente etanol [1]. Sin embargo, esta técnica presenta un bajo rendimiento de extracción , alta consumo del tiempo e implica gran cantidad de disolventes tóxicos. Por esta razón, en este trabajo, la extracción asistida por ultrasonido (EAU) se evaluó como un método alternativo, más fácil y eficiente para el aislamiento de AQ de H. pustulata en comparación con el método convencional (soxhlet). La extracción se realizó con solución de etanol-agua como disolvente, puesto que el etanol es ampliamente utilizado en la extracción de principios activos de plantas, por ser no- toxico y económico [5]. Cuatro factores fueron analizados (composición del solvente, relación solvente/muestra, temperatura y tiempo) para determinar las condiciones óptimas de extracción. Para lograr la optimización global se aplico el diseño experimental Taguchi utilizando una matriz ortogonal L9, este método minimiza el numero de ensayos, el tiempo experimental y los costos [6] La condición óptima para la extracción de AQs con ultrasonidos es: composición de solventes 60:40 (v:v, etanol:agua), relación de solvente/muestra de 20:01, la temperatura de 55 º C y un tiempo de extracción de 30 min. Los resultados mostraron que el rendimiento de AQs en la UAE a la condición óptima es aproximadamente dos veces más alto que el soxhlet. Además el análisis con Taguchi demostró que el factor más influyente es la composición de solvente, seguido por el tiempo, temperatura y relación solvente/muestra. Este estudio fue complementado con un análisis de varianza (ANOVA), indicando también que el factor mas significativo estadísticamente en la extracción de AQs es la composición del solvente.