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El estuario del Río de la Plata está expuesto a presiones antrópicas y climáticas que se manifiestanen un cambio trófico y en el desarrollo frecuente de floraciones de cianobacterias, con susconsecuentes perjuicios a las poblaciones costeras. El objetivo del presente estudio fue analizarla distribución de las cianobacterias planctónicas, a distintas escalas temporales, en un sitiolocalizado en la zona de agua dulce de la Franja Costera Sur del Río de la Plata; esta área escomúnmente usada con propósitos recreacionales y está ubicada cerca del punto de extracciónde agua para consumo de la ciudad de La Plata. Las muestras fueron extraídas considerando tresescalas temporales: horaria, diaria y semanal, durante el período estival. En el campo se midieron:temperatura, pH, oxígeno disuelto, conductividad, turbidez y radiación fotosintéticamente activa(PAR). Se extrajeron muestras de agua para análisis de nutrientes disueltos, demandas del oxígeno,clorofila a, microcistinas y fitoplancton, estas últimas con un muestreador que permitió integrarlos primeros 50 cm de la columna de agua. Los recuentos se realizaron utilizando un microscopioinvertido con una magnificación de 600X, y para la identificación de las cianobacterias se utilizoun aumento de 1000x y claves taxonómicas específicas. Los datos de viento, temperatura y mareafueron provistos por el Servicio Meteorológico Nacional y el Servicio de Hidrografía Naval. Lasmicrocistinas fueron analizadas en HPLC. Nuestros resultados mostraron que, mientras a escalasemanal la temperatura, la penetración de la luz (PAR y turbidez), la concentración de amonio,la conductividad y el pH estuvieron correlacionadas en forma positiva y significativa con la densidadtotal de cianobacterias, a escalas diaria y horaria estas variables no fueron significativas.La dirección e intensidad de los vientos predominantes, y la pleamar influenciaron significativamentela distribución de las cianobacterias a escala horaria. Considerando la variabilidad de lascondiciones ambientales, típicas de este estuario, las escalas de muestreo cortas (horarias) seríanlas más apropiadas para propósitos de monitoreo de cianobacterias, particularmente cuando sesuperan los niveles de vigilancia propuesto por la Organización Mundial de la Salud.