IFLYSIB 05383
INSTITUTO DE FISICA DE LIQUIDOS Y SISTEMAS BIOLOGICOS
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
EStudio del empaquetamiento de proteínas utilizando un modelo de cruces
Autor/es:
CARLEVARO C. MANUEL; RIOJAS ROLDAN, HÉCTOR; VERICAT, FERNANDO
Lugar:
Salta, Prov. de Salta
Reunión:
Congreso; 92 Reunión Nacional de Física de la Asociación Física Argentina; 2007
Institución organizadora:
Asociación Física Argentina
Resumen:
La determinación de la estructura tridimensional de proteinas a partir del conocimiento de la secuencia de aminoácidos que la componen es un problema que presenta un gran desafío para la física actual.
En esta comunicación abordamos este problema utilizando un modelo simplificado que consiste en caracterizar el grado de compacidad de una proteína de dos letras a través del número de entrecruzamientos (o cruces) de las uniones que forman el "backbone" de la misma.
Dichos cruces son formados por uniones separadas una distancia menor que una dada \textit{d}, y el número de cruces que se forman en la proteína se obtiene mediante simulaciones de Monte Carlo. La distancia \textit{d} se obtiene a partir de la separación existente entre las uniones \textit{i} e \textit{i+3} típica en conformaciones de hélices alfa. Los resultados se comparan con los cruces reales que se obtienen en estructuras cristalográficas de algunas proteínas.
